Method for predicting the outcome of colon cancer by analysing mirna expression

ABSTRACT

The present invention relates to a method for predicting the outcome of a cancer. More particularly, the present invention relates to a method for predicting the outcome of a cancer in a patient comprising a step consisting of determining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtained from said patient, wherein said miRNA cluster comprises: -miR.609 or, -miR.518c or, -miR.520f or, -miR.220a or, -miR.362 or, -miR.29a or, -miR.660 or, -miR.603 or, -miR.558 or, -miR519b or, -miR.494 or, -miR.130a or, -miR.639.

FIELD OF THE INVENTION

The present invention relates to a method for predicting the outcome ofa cancer.

BACKGROUND OF THE INVENTION

Cancer remains a serious public health problem in developed countries.Accordingly, to be most effective, cancer treatment requires not onlyearly detection and treatment or removal of the malignancy, but areliable assessment of the severity of the malignancy and a predictionof the likelihood of cancer recurrence. The stage of a cancer indicateshow far a cancer has spread and as consequences what the outcome of thecancer will be. Staging is important because treatment is often decidedaccording to the stage of a cancer. To date, cancers are generallyclassified according to the UICC-TNM system. The TNM (for“Tumor-Node-Metastasis”) classification system uses the size of thetumor, the presence or absence of tumor in regional lymph nodes, and thepresence or absence of distant metastases, to assign a stage and anoutcome to the tumor. The TNM system developed from the observation thatpatients with small tumours have better prognosis than those withtumours of greater size at the primary site. In general, patients withtumours confined to the primary site have better prognosis than thosewith regional lymph node involvement, which in turn is better than forthose with distant spread of disease to other organs. Accordingly,cancer can be generally divided into four stages. Stage I is verylocalized cancer with no cancer in the lymph nodes. Stage II cancer hasspread to the lymph nodes. Stage III cancer has spread near to where thecancer started. Stage IV cancer has spread to another part of the body.The assigned stage is used as a basis for selection of appropriatetherapy and for prognostic purposes.

The above clinical classifications, although they are to be useful, areimperfect and do not allow a reliable prognosis of the outcome of thecancers. Recently, a study has suggested that density, and location ofimmune cells in colorectal cancer had a prognostic value that wassuperior to and independent of those of the UICC-TNM classification(Science. 2006 Sep. 29; 313(5795):1960-4). However there is still a needfor other reliable methods that will help physicians for predicting theoutcome of a cancer in a patient.

miRNAs have been suggested to be helpful for the diagnosis andpredicting the outcome of a cancer. For example Cummins et al. (2006)describe miRNAs that are differentially expressed in colon cancer andsome that are associated with clinical outcome (Cummins et al, Proc.Natl. Acad. Sci. USA, 103 (10):3687-3692, 2006). Michael et al. (2003)describe miRNAs that are down-regulated in colorectal adenocarcinomas ascompared to matched normal tissues, in particular miR.143 and miR145(Michael et al, Mol. Cancer. Res., 1:882-891, 2003). Bandres et al.(2006) describe miRNA in paired colorectal tumor and normal adjacenttissue and reported the differential expression of miR.31 in Stage IIand Stage IV colorectal cancer cells (Bandres et al, Molec. Cancer,5:29, 2006. Xi et al. (2006a, 2006b)), evaluated the prognostic value ofseveral miRNAs in colorectal cancer and showed that higher expression ofmiR.200c was associated with shorter survival time (Xi et al,BiomarkInsights, 2:113-121, 2006a. Xi et al, Clin Cancer Res.,12:2014-2024, 2006b). Schetter et al., (2008) reported that a highexpression of miR.21 is associated with a poor survival and poortherapeutic response in colorectal cancer patients (Schetter et al,JAMA, 299(4):425-436, 2008).

However, there is no current method based on miRNAs that allow having aprognostic value that is superior to and independent of those of theUICC-TNM classification.

SUMMARY OF THE INVENTION

The present invention relates to a method for predicting the outcome ofa cancer in a patient comprising a step consisting of determining theexpression level of a miRNA cluster in a sample obtained from saidpatient, wherein said miRNA cluster comprises:

-   -   miR.609 or,    -   miR.518c or,    -   miR.520f or,    -   miR.220a or,    -   miR.362 or,    -   miR.29a or,    -   miR.660 or,    -   miR.603 or,    -   miR.558 or,    -   miR519b or,    -   miR.494 or,    -   miR.130a or,    -   miR.639.

DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

From a cohort of 77 Stage I/II/III patients the inventors havedetermined various miRNA clusters that can be suitable for predictingthe outcome of a cancer in a patient (Table 1 to Table 17). Theydemonstrated, by determining the ROC curves for each of said clustersthat most of them provide greater sensitivities and selectivities thanthe UICC-TNM classification does for predicting the outcome of a cancer.

Accordingly, the invention relates to methods for predicting the outcomeof a cancer in a patient comprising a step consisting of determining theexpression level of said miRNA clusters in a sample obtained from saidpatient.

The term “miRNAs” refers to microRNA molecules that are generally 21 to22 nucleotides in length, even though lengths of 19 and up to 23nucleotides have been reported. miRNAs are each processed from a longerprecursor RNA molecule (“precursor miRNA”). Precursor miRNAs aretranscribed from non-protein-encoding genes. The precursor miRNAs havetwo regions of complementarity that enables them to form a stem-loop- orfold-back-like structure, which is cleaved in animals by a ribonucleaseIll-like nuclease enzyme called Dicer. The processed miRNA is typicallya portion of the stem. The processed miRNA (also referred to as “maturemiRNA”) become part of a large complex to down-regulate a particulartarget gene. All the miRNAs pertaining to the invention are known per seand sequences of them are publicly available from the data basehttp://microrna.sanger.ac.uk/sequences/. The miRNAs of the invention arelisted in Table A:

TABLE A list of the miRNAs according to the invention miRNA miRBasemiR.609 MI0003622 miR.519b MI0003151 miR.520f MI0003146 miR.558MI0003564 miR.603 MI0003616 miR.220a MI0000297 miR.376a* MI0000784miR.639 MI0003654 miR.130a MI0000448 miR.338 MI0000814 miR.26a MI0000083miR.29a MI0000087 miR.494 MI0003134 miR.518c MI0003159 miR.660 MI0003684miR.369-3p MI0000777 miR.362 MI0000762

The term “miRNA cluster” refers to a set of at least one miRNA selectedfrom the group consisting in the miRNAs of Table A. Accordingly, saidmiRNA cluster may comprise 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13,14, 15, 16, or 17 miRNAs of Table A.

As used herein, the term “patient” denotes a mammal. In a preferredembodiment of the invention, a patient according to the invention is ahuman.

As used herein, the term “sample” refers to a sample that containsnucleic acid materials.

As used herein, the term “nucleic acid” is meant a polymeric compoundcomprising nucleoside or nucleoside analogs which have nitrogenousheterocyclic bases, or base analogs, linked together by nucleic acidbackbone linkages (e.g., phosphodiester bonds) to form a polynucleotide.Conventional RNA and DNA are included in the term “nucleic acid” as areanalogs thereof. The nucleic acid backbone may include a variety oflinkages, for example, one or more of sugar-phosphodiester linkages,peptide-nucleic acid bonds, phosphorothioate or methylphosphonatelinkages or mixtures of such linkages in a single oligonucleotide. Sugarmoieties in the nucleic acid may be either ribose or deoxyribose, orsimilar compounds with known substitutions. Conventional nitrogenousbases (A, G, C, T, U), known base analogs (eg inosine), derivatives ofpurine or pyrimidine bases and “abasic” residues (i.e., no nitrogenousbase for one or more backbone positions) are included in the termnucleic acid. That is, a nucleic acid may comprise only conventionalsugars, bases and linkages found in RNA and DNA, or may include bothconventional components and substitutions (e.g., conventional bases andanalogs linked via a methoxy backbone, or conventional bases and one ormore base analogs linked via an RNA or DNA backbone).

Typically the “sample” means any tissue sample derived from the patient.Said tissue sample is obtained for the purpose of the in vitroevaluation. The sample can be fresh, frozen, fixed (e.g., formalinfixed), or embedded (e.g., paraffin embedded). In a particularembodiment the sample results from biopsy performed in the tumour sampleof the patient. For example an endoscopical biopsy performed in thebowel of the patient affected by a colorectal cancer.

miRNA Clusters Based on miR.609

An aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.609.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.520f,miR.558, miR.603, miR.220a, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.518c, miR.660, miR.369-3p and miR.362.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.609. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.609. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.558

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.558.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.520f,miR.609, miR.603, miR.220a, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.518c, miR.660, miR.369-3p and miR.362.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.558. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.558. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.603

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.603.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.520f,miR.609, miR.558, miR.220a, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.518c, miR.660, miR.369-3p and miR.362.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.603+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.603+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.603+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.603+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.603. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.603. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.518c

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.518c.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.520f,miR.609, miR.558, miR.220a, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.362.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.518c. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.518c. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR520f

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.520f.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.220a, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.362.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.520f+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.376a*

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.376a*.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.520f. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combination.miR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.520f. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.362

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.362.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.220a, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.362.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.362+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.362+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a+miR.362+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.362+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.362. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.519b+miR.29a+miR.362+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.519b+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.362. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.220a

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.220a.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.220a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.220a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.220a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.220a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.29a

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.29a.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.519b, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.220a, miR.494, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.29a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.29a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.519b

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.519b.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.29a, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.220a, miR.494, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.519b+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.519b+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.519b+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.519b+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.519b+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.519b+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.519b+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.519b. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.519b+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.519b+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.519b+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.519b+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.519b+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.519b+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.519b+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.519b. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.494

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.494.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.29a, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.220a, miR.519b, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.494.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.376a*+miR.494.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a*+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.376a*+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.494. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.494. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.130a

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.130a.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.29a, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.639, miR.494, miR.338,miR.26a, miR.220a, miR.519b, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.520f+miR.130a.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.130a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.130a+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.130a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.130a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.130a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.130a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.130a. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.130a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.130a. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.639

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.639.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.29a, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.130a, miR.494, miR.338,miR.26a, miR.220a, miR.519b, miR.603, miR.660, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.639 In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.609+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.376a*+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.376a*+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.639. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.376a*+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

miRNA Clusters Based on miR.660

A further aspect of the invention relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient comprising a step consisting ofdetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.660.

The inventors have been indeed demonstrated that said miRNA provides agreater accuracy for predicting the outcome of a cancer than theUICC-TNM classification (i.e. the miRNA provides a ROC curve whichresults in a larger area under the curve than the one with TNM) (seeTable 1).

In a particular embodiment, the miRNA cluster further comprises at leastone miRNA selected from the group consisting of miR.29a, miR.518c,miR.609, miR.558, miR.362, miR.376a*, miR.130a, miR.494, miR.338,miR.26a, miR.220a, miR.519b, miR.603, miR.639, miR.369-3p and miR.520f.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 2 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 2 which comprisesmiR.660 In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 3 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 3 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.603+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 4 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 4 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 5 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 5 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists of in thecombination of 6 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 6 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 7 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 7 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination miR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 8 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 8 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 9 miRNAs. For example, said miRNA cluster may be selectedaccording to any combination described in Table 9 which comprisesmiR.660. In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 10 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 10 whichcomprises miR.660. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.660.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 11 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 11 whichcomprises miR.660. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 12 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 12 whichcomprises miR.660. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 13 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 13 whichcomprises miR.660. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 14 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 14 whichcomprises miR.660. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 15 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 15 whichcomprises miR.660. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 16 miRNAs. For example, said miRNA cluster may beselected according to any combination described in Table 16 whichcomprises miR.639. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

In a particular embodiment, the miRNA cluster consists in thecombination of 17 miRNAs. In a particular embodiment, the miRNA clusterconsists in the combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.

Techniques for Measuring the Expression Level of the miRNA Clusters

Measuring the expression level of the miRNA clusters of the invention inthe sample obtained form the patient can be performed by a variety oftechniques.

For example the nucleic acid contained in the samples (e.g., cell ortissue prepared from the patient) is first extracted according tostandard methods, for example using lytic enzymes or chemical solutionsor extracted by nucleic-acid-binding resins following the manufacturer'sinstructions. The extracted miRNAs is then detected by hybridization(e.g., Northern blot analysis) and/or amplification (e.g., RT-PCR).Preferably quantitative or semi-quantitative RT-PCR is preferred.Real-time quantitative or semi-quantitative RT-PCR is particularlyadvantageous. Other methods of Amplification include ligase chainreaction (LCR), transcription-mediated amplification (TMA), stranddisplacement amplification (SDA) and nucleic acid sequence basedamplification (NASBA).

In a particular embodiment, the determination comprises contacting thesample with selective reagents such as probes or primers and therebydetecting the presence, or measuring the amount of miRNAs originally inthe sample. Contacting may be performed in any suitable device, such asa plate, microtiter dish, test tube, well, glass, column, and so forthIn specific embodiments, the contacting is performed on a substratecoated with the reagent, such as a miRNA array. The substrate may be asolid or semi-solid substrate such as any suitable support comprisingglass, plastic, nylon, paper, metal, polymers and the like. Thesubstrate may be of various forms and sizes, such as a slide, amembrane, a bead, a column, a gel, etc. The contacting may be made underany condition suitable for a detectable complex, such as a miRNAshybrid, to be formed between the reagent and the miRNAs of the sample.

Nucleic acids exhibiting sequence complementarity or homology to themiRNAs of interest herein find utility as hybridization probes oramplification primers. It is understood that such nucleic acids need notbe identical, but are typically at least about 80% identical to thehomologous region of comparable size, more preferably 85% identical andeven more preferably 90-95% identical. In certain embodiments, it willbe advantageous to use nucleic acids in combination with appropriatemeans, such as a detectable label, for detecting hybridization. A widevariety of appropriate indicators are known in the art including,fluorescent, radioactive, enzymatic or other ligands (e.g.avidin/biotin).

The probes and primers are “specific” to the miRNAs they hybridize to,i.e. they preferably hybridize under high stringency hybridizationconditions (corresponding to the highest melting temperature Tm, e.g.,50 formamide, 5× or 6×SCC. SCC is a 0.15 M NaCl, 0.015 M Na-citrate).

Accordingly, the present invention concerns the preparation and use ofmiRNA arrays or miRNA probe arrays, which are macroarrays or microarraysof nucleic acid molecules (probes) that are fully or nearlycomplementary or identical to a plurality of miRNA molecules positionedon a support or support material in a spatially separated organization.Macroarrays are typically sheets of nitrocellulose or nylon upon whichprobes have been spotted. Microarrays position the nucleic acid probesmore densely such that up to 10,000 nucleic acid molecules can be fitinto a region typically 1 to 4 square centimeters. Microarrays can befabricated by spotting nucleic acid molecules, e.g., genes,oligonucleotides, etc., onto substrates or fabricating oligonucleotidesequences in situ on a substrate. Spotted or fabricated nucleic acidmolecules can be applied in a high density matrix pattern of up to about30 non-identical nucleic acid molecules per square centimeter or higher,e.g. up to about 100 or even 1000 per square centimeter. Microarraystypically use coated glass as the solid support, in contrast to thenitrocellulose-based material of filter arrays. By having an orderedarray of miRNA-complementing nucleic acid samples, the position of eachsample can be tracked and linked to the original sample. A variety ofdifferent array devices in which a plurality of distinct nucleic acidprobes are stably associated with the surface of a solid support areknown to those of skill in the art. Useful substrates for arrays includenylon, glass, metal, plastic, latex, and silicon. Such arrays may varyin a number of different ways, including average probe length, sequenceor types of probes, nature of bond between the probe and the arraysurface, e.g. covalent or non-covalent, and the like.

After an array or a set of miRNA probes is prepared and/or the miRNA inthe sample or miRNA probe is labeled, the population of target nucleicacids is contacted with the array or probes under hybridizationconditions, where such conditions can be adjusted, as desired, toprovide for an optimum level of specificity in view of the particularassay being performed. Suitable hybridization conditions are well knownto those of skill in the art and reviewed in Sambrook et al. (2001). Ofparticular interest in many embodiments is the use of stringentconditions during hybridization. Stringent conditions are known to thoseof skill in the art.

Alternatively, miRNAs quantification method may be performed by usingstem-loop primers for reverse transcription (RT) followed by a real-timeTaqMan® probe. Typically, said method comprises a first step wherein thestem-loop primers are annealed to miRNA targets and extended in thepresence of reverse transcriptase. Then miRNA-specific forward primer,TaqMan® probe, and reverse primer are used for PCR reactions.Quantitation of miRNAs is estimated based on measured CT values.

Many miRNA quantification assays are commercially available from Qiagen(S. A. Courtaboeuf, France) or Applied Biosystems (Foster City, USA).

Expression level of a miRNA may be expressed as absolute expressionlevel or normalized expression level. Typically, expression levels arenormalized by correcting the absolute expression level of a miRNA bycomparing its expression to the expression of a mRNA that is not arelevant for determining the outcome of the cancer in the patient, e.g.,a housekeeping mRNA that is constitutively expressed. Suitable mRNA fornormalization include housekeeping mRNAs such as the U6, U24, U48 andS18. This normalization allows the comparison of the expression level inone sample, e.g., a patient sample, to another sample, or betweensamples from different sources.

Reference Levels

It is specifically contemplated that the invention can be used forpredicting the outcome of a cancer in a patient.

Therefore the methods of the invention further comprises a stepconsisting of comparing the expression level of one miRNA cluster (asabove described) determined in the sample of the patient with areference expression level of said miRNA cluster, wherein a differencebetween said expression levels is indicative of the outcome of thecancer in the patient.

Typically, the reference expression levels according to the inventionare correlated with an outcome. The reference expression levels may thusconsist in the expression level of said miRNA cluster in a tissuerepresentative of an outcome. Accordingly, the reference levels may bepredetermined by carrying out a method comprising the steps of a)providing at least one collection of tumor tissue samples selected fromthe group consisting of a collection of tumor tissue samples from cancerpatients having different outcomes, b) determining for each tumor tissuesample comprised in a collection of tumor tissue samples provided atstep a), the expression level of said miRNA clusters.

Typically, the expression level determined for one miRNA cluster may bealso expressed as a score. Typically said score may be obtained by i)determining for every gene of the cluster their expression level in thesample ii) allocating for every miRNA a positive coefficient (e.g. +1)when the miRNA is associated with a good prognosis and a negativecoefficient (e.g. −1) when the miRNA is associated with a bad prognosisand iii) multiplying the expression level of one miRNA with thecoefficient allocated in step ii) and iv) adding up all valuesdetermining at step iii) for obtaining said score. Typically acoefficient of +1 is allocated to the miRNAs associated with a goodprognosis, namely miR.609, miR.519b, miR.520f, miR.558, miR.603 andmiR.220a and a coefficient of −1 is allocated to the genes associateswith a bad prognosis, namely miR.376a*, miR.639, miR.130a, miR.338,miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.518c, miR.660, miR.369-3p and miR.362.Preferably, the expression levels are expressed as normalized expressionlevels as above described.

The advantage of said score is to make easier the comparison step withthe reference levels that may be expressed as “cut-off values”. Forexample the reference (“cut-off”) value represents the score calculatedfor the miRNA cluster of interest in a tissue sample representative of aspecific cancer outcome. The cut-off values may also be predetermined bycarrying out a method comprising the steps of:

a) selecting a miRNA cluster for which a reference value is to bedetermined;

b) providing a collection of tumor tissue samples from cancer patients;

c) providing, for each tumor sample provided at step b), informationrelating to the actual clinical outcome for the corresponding cancerpatient;

d) providing a serial of arbitrary values for said miRNA clusterobtained at step a)

e) calculated the score of said miRNA cluster provided at step a) foreach tumor tissue sample contained in the collection provided at step b)

f) classifying said tumor samples in two groups for one specificarbitrary value provided at step c), respectively:

(i) a first group comprising tumor samples that exhibit a score for saidmiRNA cluster that is lower than the said arbitrary value contained inthe said serial of values;

(ii) a second group comprising tumor samples that exhibit a score forsaid miRNA cluster that is higher than said arbitrary value contained inthe said serial of values;

whereby two groups of tumor samples are obtained for the said specificvalue, wherein the tumors samples of each group are separatelyenumerated;

g) calculating the statistical significance between (i) the score forsaid miRNA cluster obtained at step e) and (ii) the actual clinicaloutcome of the patients from which tumor samples contained in the firstand second groups defined at step f) derive;

h) reiterating steps f) and g) until every arbitrary value provided atstep d) is tested;

i) setting the said reference value (“cut-off” value) as consisting ofthe arbitrary value for which the highest statistical significance (mostsignificant) has been calculated at step g). As it is disclosed above,said method allows the setting of a single “cut-off” value permittingdiscrimination between bad and good outcome prognosis. Practically, highstatistical significance values (e.g. low P values) are generallyobtained for a range of successive arbitrary values, and not only for asingle arbitrary value. Thus, in one alternative embodiment of themethod of determining “cut-off” values above, a minimal statisticalsignificance value (minimal threshold of significance, e.g. maximalthreshold P value) is arbitrarily set and the range of arbitrary valuesfor which the statistical significance value calculated at step g) ishigher (more significant, e.g. lower P value) are retained, whereby arange of values is provided. Said range of values consist of a “cut-off”value according to the invention. According to this specific embodimentof a “cut-off” value, bad or good clinical outcome prognosis can bedetermined by comparing the score obtained for the miRNA cluster withthe range of values delimiting said “cut-off” value. In certainembodiments, a cut-off value consisting of a range of values for theconsidered miRNA cluster, consists of a range of values centred on thevalue for which the highest statistical significance value is found(e.g. generally the minimum P value which is found). Typically, thecut-off values as above described are determined from a cohort ofpatient that has a sufficient size enough for allowing a reproducibleand accurate discrimination between patients with good prognosis andpatients with bad prognosis.

In particular embodiment, the cut-off values as described above may bereported in a table, so that the physician can compare the scoreobtained for a patient with said values and can easily determined thecancer outcome for said patient.

Cancers

The methods of the invention may be performed for any type of cancersselected from the group consisting of adrenal cortical cancer, analcancer, bile duct cancer (e.g. periphilar cancer, distal bile ductcancer, intrahepatic bile duct cancer), bladder cancer, bone cancer(e.g. osteoblastoma, osteochrondroma, hemangioma, chondromyxoid fibroma,osteosarcoma, chondrosarcoma, fibrosarcoma, malignant fibroushistiocytoma, giant cell tumor of the bone, chordoma, lymphoma, multiplemyeloma), brain and central nervous system cancer (e.g. meningioma,astocytoma, oligodendrogliomas, ependymoma, gliomas, medulloblastoma,ganglioglioma, Schwannoma, germinoma, craniopharyngioma), breast cancer(e.g. ductal carcinoma in situ, infiltrating ductal carcinoma,infiltrating, lobular carcinoma, lobular carcinoma in, situ,gynecomastia), Castleman disease (e.g. giant lymph node hyperplasia,angiofollicular lymph node hyperplasia), cervical cancer, colorectalcancer, endometrial cancer (e.g. endometrial adenocarcinoma,adenocanthoma, papillary serous adnocarcinroma, clear cell), esophaguscancer, gallbladder cancer (mucinous adenocarcinoma, small cellcarcinoma), gastrointestinal carcinoid tumors (e.g. choriocarcinoma,chorioadenoma destruens), Hodgkin's disease, non-Hodgkin's lymphoma,Kaposi's sarcoma, kidney cancer (e.g. renal cell cancer), laryngeal andhypopharyngeal cancer, liver cancer (e.g. hemangioma, hepatic adenoma,focal nodular hyperplasia, hepatocellular carcinoma), lung cancer (e.g.small cell lung cancer, non-small cell lung cancer), mesothelioma,plasmacytoma, nasal cavity and paranasal sinus cancer (e.g.esthesioneuroblastoma, midline granuloma), nasopharyngeal cancer,neuroblastoma, oral cavity and oropharyngeal cancer, ovarian cancer,pancreatic cancer, penile cancer, pituitary cancer, prostate cancer,retinoblastoma, rhabdomyosarcoma (e.g. embryonal rhabdomyosarcoma,alveolar rhabdomyosarcoma, pleomorphic rhabdomyosarcoma), salivary glandcancer, skin cancer (e.g. melanoma, nonmelanoma skin cancer), stomachcancer, testicular cancer (e.g. seminoma, nonseminoma germ cell cancer),thymus cancer, thyroid cancer (e.g. follicular carcinoma, anaplasticcarcinoma, poorly differentiated carcinoma, medullary thyroid carcinoma,thyroid lymphoma), vaginal cancer, vulvar cancer, and uterine cancer(e.g. uterine leiomyosarcoma). In a particular embodiment, the cancer isa colorectal cancer.

In a particular embodiment, the cancer is at Stage I, II, III, or IV asdetermined by the TNM classification, but however the present inventionis accurately useful for predicting the outcome of the cancer when saidcancer has been classified as Stage I, II or III by the TNMclassification.

Methods of the invention can be applied for monitoring the treatment(e.g., drug compounds) of the patient. For example, the effectiveness ofan agent to affect the expression level of the miRNA cluster (as hereinafter described) according to the invention can be monitored duringtreatments of patients receiving anti-cancer treatments.

The “anti-cancer treatment” that is referred to in the definition ofstep a) above relate to any type of cancer therapy undergone by thecancer patients previously to collecting the tumor tissue samples,including radiotherapy, chemotherapy and surgery, e.g. surgicalresection of the tumor.

Accordingly, the present invention relates to a method for monitoringthe treatment of patient affected with a cancer, said method comprisingthe steps consisting of:

i) predicting the outcome of said cancer before said treatment byperforming the method of the invention

ii) predicting the outcome of said cancer after said treatment byperforming the method of the invention

iii) and comparing the outcome predicted a step i) with the outcomepredicted at step ii) wherein a difference between said outcomes isindicative of the effectiveness of the treatment.

The present invention also relates to a method for predicting theoutcome of a cancer in a patient, wherein said method may be usedindependently from conventional clinicopatholological cancer stagingmethods, and which method comprising determining the expression level ofa miRNA cluster according to the invention.

Kits

A further object of the invention relates to kits for performing themethods of the invention, wherein said kits comprise means for measuringthe expression level of the miRNA clusters of the invention in thesample obtained from the patient. The kits may include probes, primersmacroarrays or microarrays as above described.

For example, the kit may comprise a set of miRNA probes as abovedefined, usually made of DNA, and that may be pre-labelled.Alternatively, probes may be unlabelled and the ingredients forlabelling may be included in the kit in separate containers. The kit mayfurther comprise hybridization reagents or other suitably packagedreagents and materials needed for the particular hybridization protocol,including solid-phase matrices, if applicable, and standards.

Alternatively the kit of the invention may comprise amplificationprimers (e.g. stem-loop primers) that may be pre-labelled or may containan affinity purification or attachment moiety. The kit may furthercomprise amplification reagents and also other suitably packagedreagents and materials needed for the particular amplification protocol.

In a particular embodiment, the kit of the invention comprises means fordetermining the expression level of a miRNA cluster in a sample obtainedfrom said patient, wherein said miRNA cluster comprises miR.609 ormiR.558, or miR.603, or miR.518c, or miR.520f, or miR.362, or miR.220a,or miR.29a, or miR.519b, or miR.494, or miR.130a, or miR.639, ormiR.660.

In a particular embodiment, the kit of the invention comprises means fordetermining the expression level of a miRNA represented by anycombination described in Table 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13,14, 15, or 16 which comprises miR.609 or miR.558, or miR.603, ormiR.518c, or miR.520f, or miR.362, or miR.220a, or miR.29a, or miR.519b,or miR.494, or miR.130a, or miR.639, or miR.660.

The invention will be further illustrated by the following figures andexamples. However, these examples and figures should not be interpretedin any way as limiting the scope of the present invention.

FIGURES

FIG. 1: DFS KM curves for the two clusters. Cluster 1 and Cluster 2 withgood outcome are merged. The hazard ratio (HR) is 10.1, the concordanceindex (CI) is 70.2 and the Brier Score (BS) is 0.23.

FIG. 2: Pearson correlation matrix for the final selected 17 miRNAs forthe deltaCt qPCR data on 77 patients, clustered using euclideandistance.

FIG. 3: DFS KM curves based on the dichotomized linear predictor of thefitted Cox model for all 17 miRNAs at 0 months follow-up. The all overhazard ratio (HR) is 5.12 (logrank P value<0.001) and the Brier Score(BS) is 0.205.

FIG. 4: ROC curves for the final selected 17 miRNAs, miR609, and UICC.

EXAMPLE Material & Methods

Patients and data: The records of colorectal cancer (CRC) patients whounderwent a primary resection of their tumor at the Laennec-HEGPHospitals between 1996 and 2004 were reviewed and previously described(Galon et al. 2006). All frozen tumor samples (n=77) from UICC-TNM StageI-III patients available from Laennec-HEGP Hospitals from 1996-2004,with sufficient RNA quality and quantity, were selected. The RNA samplesanalyzed were from 77 different patients. These patients were used formiRNA expression experiments (Taqman qPCR). The observation time in thecohorts was the interval between diagnosis and last contact (death orlast follow-up). Data were censored at the last follow-up for patientswithout relapse, or death. The min:max values until progression/death orlast follow-up were (0:136) months, respectively. Eight patients withincomplete data records were excluded from the analysis. Time torecurrence or disease-free time was defined as the interval from thedate of surgery to confirmed tumor relapse date for relapsed patientsand from the date of surgery to the date of last follow-up fordisease-free patients.

Histopathological and clinical findings were scored according to theUICC-TNM staging system. Follow-up data were collected prospectively andupdated. A secure Web-based database, TME.db (Tumor MicroEnvironmentDatabase), was built on a 3-tier architecture using Java-2Enterprise-Edition (J2EE) to integrate the clinical data and the datafrom high-throughput technologies. Ethical, Legal and SocialImplications were approved by ethical review board.

Statistical analysis: All signatures were build based on 69 patients (8patients were removed due to missing values) from a UICC-TNM Stage I-IIICRC patient cohort and all 17 selected final miRs. The predictiveperformance for each miRNA combination was assessed by the Harrel'sconcordance index (c-index) and time-dependent c-index (C_(τ) index) (RrisksetROC package) and correspond to the area under the receiveroperator curve (AUC) (c-index (Harrell F E et al. 1996) and iAUC(Heagerty P J et al., 2005), respectively). A summary table for eachpossible model combination length from 1 to 16 miRs was created andsorted by the highest C_(τ) index. Additionally each table shows thenumber of miRNAs remaining significant in the cox model and a P-value(U-statistics, Pencina M J et al., 2008) comparing the performance ofall models of a certain number of miRNAs with the one with the highestperformance (largest C_(τ) index) (R risksetROC and Hmisc package).

Time-dependent area under the ROC(t) (iAUC): Since the event occurrenceis time-dependent, time-dependent ROC curves are more appropriate thanconventional ones (Heagerty P J et al., 2005). Heagerty P J et al.proposed to summarize the discrimination potential of a risk score,estimated at the diagnosis/surgery time t=0, by calculating ROC curvesfor cumulative event occurrence by time t. From the ROC curve ROC(t) theintegrated area under the curve over time (iAUC) can be calculated. Thelarger the iAUC at time t, the better is the predictability of the timeto event (TTE) at time t as well as the average predictability of theTTE.

The concordance index (c-index): The concordance index (c-index)calculates the probability that, for a pair of randomly chosencomparable patients, the patient with the higher risk prediction willexperience an event before the lower risk patient. The c-index is ageneralization of the AUC(t) (iAUC), an can not represent the evolutionof performance with respect to time (Harrell FE et al., 1996). Thelarger c-index, the better is the predictability of the time to event(TTE).

Results

Selection of the relevant miRNAs: In a cohort of 77 Stage I/II/IIIpatients for 365 micro-RNAs (miRNAs) we determined the logranksignificance of each single marker using the minimal P-value approachfor the dichotomization. The obtained P-values were corrected usingAltman et al. (Altman, D. G., Lausen, B., Sauerbrei, W. & Schumacher, M.Dangers of using “optimal” cutpoints in the evaluation of prognosticfactors. J Natl Cancer Inst, 1994; 86:829-35.) and were additionallycross validated. The Hazard ratios obtained with the minimal P-valuedichotomization were corrected using Hollaender et al. (Hollaender N,Sauerbrei W, Schumacher M. Confidence intervals for the effect of aprognostic factor after selection of an ‘optimal’ cutpoint. Stat Med,2004; 23(11):1701-13.). The final selection of the miRNAs was based onthe median cross validation P-value. We removed from the final miRNAsignature miRNAs which were not expressed (none of the determined valueswere larger than deltaCt>32) although they where logrank significant. Wefinally end up with 17 markers, where 6 show a good out come when highexpressed and 11 show a bad outcome when high expressed (see Table B).All analyzes were performed using the R survival package.

TABLE B Final selected miRNAs optimal median optimal optimal optimallogrank Hazard median Hazard Hazard optimal logrank P value ratiologrank ratio ratio logrank P value cross Marker (HR) P value (HR)corrected P value corrected validated miR.609 0.239 0.0057 0.194 0.240.0012 0.0576 0.0276 miR.519b 0.312 0.0209 0.251 0.31 0.0033 0.13590.0431 miR.520f 0.321 0.0217 0.252 0.31 0.0016 0.0731 0.0651 miR.5580.334 0.0198 0.137 0.19 0.0019 0.0866 0.0389 miR.603 0.337 0.0213 0.1320.18 0.0014 0.0682 0.0299 miR.220a 0.351 0.029 0.144 0.20 0.0027 0.11620.0531 miR.376a* 1.199 0.6935 3.812 3.23 0.0023 0.1022 0.0336 miR.6391.339 0.5253 6.338 4.55 0.0047 0.1774 0.0231 miR.130a 1.635 0.2868 6.5454.76 0.0041 0.1596 0.0316 miR.338 1.687 0.2861 4.863 3.70 0.0005 0.02780.0146 miR.26a 1.861 0.1857 5.04 3.85 0.0045 0.1707 0.0416 miR.29a 2.5620.0483 7.257 5.26 0.0019 0.0877 0.0547 miR.494 3.333 0.0149 4.415 3.570.0042 0.1616 0.0406 miR.518c 3.514 0.0103 4.694 3.85 0.0011 0.05630.0214 miR.660 3.743 0.0119 4.67 3.85 0.0026 0.1118 0.054: miR.369-4.533 0.0033 5.934 4.76 0.0013 0.0649 0.012 3p miR.362 4.634 0.00284.899 4.00 0.0018 0.0818 0.0215

6 miRNAs show a good out come (HR<1) when high expressed: miR.609,miR.519b, miR.520f, miR.558, miR.603 and miR.220a.

11 miRNAs show a bad outcome (HR>1) when high expressed: miR.376a*,miR.639, miR.130a, miR.338, miR.26a, miR.29a, miR.494, miR.518c,miR.660, miR.369-3p and miR.362.

Cluster for the 17 final selected signature miRNA qPCR data clustered on77 patients (Stage I-III): Before clustering the deltaCt qPCR data foreach miRNA was mean centered and divided by its standard deviation. ThemiRNAs where hierarchical clustered using the complete linkage algorithmand Pearson correlation as distance measurement. Three major patientclusters were defined, two with good outcome (Cluster1-2) and one withpoor outcome (Cluster3) (FIG. 1).

Time-dependent ROC Curves and iAUC (Time-dependent predictive accuracy)using Cox regression models for disease-free survival (DFS): In thecohorts of Stage I/II, Stage I/II/III and Stage III patients using the17 final selected micro-RNAs (miRNAs) as well as Version1 and Version2of the clustered data we determined the time-dependent predictiveaccuracy (integrated Area Under the ROC curves, iAUC) (Heagerty P J,Zheng Y. Survival model predictive accuracy and ROC curves. Biometrics,2005, March; 61(1):92-105.)

All signatures show stable time-dependent ROC curves and none of thesignatures violate the cox proportional hazards assumption.

The ROC and AUC curves were drawn based on the linear predictor of afitted Cox regression model for the respective miRNA or miRNAcombination were the miRNA data entered un-dichotimized into the model.Each circle in the iAUC plot indicates an event (relapse) of a patient(FIG. 3). The ROC and AUC curves were calculated based on the LocalCoxmethod in case the marker was violating the Hazards assumptions,otherwise the Cox method was used. The analyzes were performed using theR survival and risksetROC packages. All AUC characteristics for allcombination markers are described in Table 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9,10, 11, 12, 13, 14, 15, and 16. The best combinations are described inTable 17.

Correlation matrix cluster for the 17 final selected signature miRNAqPCR data clustered on 77 patients (Stage I-III): The correlation matrixcluster show two major cluster (FIG. 2). A high correlation cluster withthe six miRs with good outcome and a high correlation cluster with thepoor outcome miRNAs. Negative correlation can be seen between those twoclusters showing an inverse expression of those miRNAs. A highcorrelation pattern between miRNAs show a probable redundancy amongthose miRNAs. E.g. miR.29a and miR130a have a highly similar correlationpattern as well as miR.26a and miR.338, which would suggest a possiblereplacement by one of them. Other examples are described in thefollowings Tables:

TABLE C 4 Marker_Combination all miRs c_tau miR.558 + miR.603 +miR.220a + miR.518c 0.7646 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.518c0.7639

TABLE D 4 Marker_Combination all miRs c_tau miR.609 + miR.26a +miR.29a + miR.518c 0.7609 miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.518c 0.7608

TABLE E 5 Marker_Combination all miRs c_tau miR.609 + miR.603 +miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.7983 miR.609 + miR.558 + miR.29a +miR.376a* + miR.518c 0.7913

TABLE F 6 Marker_Combination all miRs c_tau miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.29a + 0.8060 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.29a + 0.8050 miR.376a* + miR.518c

TABLE G 7 Marker_Combination all patients c_tau miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.29a + 0.8066 miR.660 + miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.29a + 0.8063 miR.130a + miR.376a* + miR.518c

TABLE H 8 Marker_Combination all patients c_tau miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.8113 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.660 + miR.29a + 0.8111 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c

Some of the miRNAs are redundant and may share common biologicalfunctions which makes them replaceable among each other. This is ofadvantage in case some the miRNAs are not expressed or are notmeasurable because of technical reasons.

TABLE 1 clusters of 1 miRNA c_tau pv compared to top Cluster of 1 miRlevel signature miR.609 miR.609 0.66 NaN miR.558 0.66 0.418938974miR.603 0.66 0.190043508 miR.518c 0.65 0.394113397 miR.520f 0.640.483494013 miR.362 0.64 0.432657709 miR.220a 0.63 0.436890827 miR.29a0.62 0.312018624 miR.519b 0.62 0.226161064 miR.494 0.61 0.158371367miR.130a 0.6 0.189293501 miR.639 0.6 0.168935983 miR.660 0.590.170064551 UICC 0.59 NaN miR.26a 0.57 0.059277098 miR.369.3p 0.550.08341555 miR.338 0.54 0.054392511 miR.376a* 0.54 0.015577754

TABLE 2 clusters of 2 miRNAs c_tau pv compared to top signature Clusterof 2 miRs level miR.603 + miR.518c miR.603 + miR.518c 0.73 NaN miR.558 +miR.518c 0.73 0.009268576 miR.609 + miR.29a 0.72 0.423370924 miR.558 +miR.609 0.72 0.482705956 miR.220a + miR.518c 0.72 0.001073457 miR.609 +miR.518c 0.72 0.134186365 miR.558 + miR.520f 0.7 0.171004128 miR.609 +miR.520f 0.7 0.167116274 miR.558 + miR.603 0.7 0.188187249 miR.519b +miR.518c 0.69 0.000904262 miR.558 + miR.362 0.69 0.086851866 miR.558 +miR.29a 0.69 0.122648778 miR.520f + miR.29a 0.69 0.14900018 miR.603 +miR.29a 0.68 0.02436506 miR.603 + miR.494 0.68 0.066852154 miR.520f +miR.130a 0.68 0.1378426 miR.520f + miR.26a 0.68 0.138396835 miR.603 +miR.130a 0.68 0.044534014 miR.603 + miR.362 0.68 0.01236297 miR.558 +miR.130a 0.68 0.104285811 miR.603 + miR.639 0.68 0.038208676 miR.603 +miR.369.3p 0.67 0.094691498 miR.603 + miR.660 0.67 0.01385758 miR.603 +miR.220a 0.67 0.033359616 miR.29a + miR.518c 0.67 0.038492703 miR.220a +miR.29a 0.66 0.03205418 miR.369.3p + 0.66 0.014816909 miR.518c miR.603 +miR.26a 0.66 0.044908534 miR.220a + miR.362 0.66 0.011719433 miR.603 +miR.338 0.66 0.04870573 miR.519b + miR.29a 0.65 0.009625124 miR.220a +miR.130a 0.65 0.032322123 miR.130a + miR.362 0.65 0.033378678

TABLE 3 clusters of 3 miRNAs pv compared to top c_tau signaturemiR.558 + Cluster of 3 miRs level miR.609 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.518c 0.76 NaN miR.558 + miR.603 + miR.518c 0.75 0.247784245miR.609 + miR.29a + miR.518c 0.75 0.164812866 miR.603 + miR.220a +miR.518c 0.75 0.488976647 miR.609 + miR.603 + miR.518c 0.75 0.34714351miR.558 + miR.520f + miR.518c 0.75 0.362175562 miR.558 + miR.609 +miR.29a 0.75 0.355216853 miR.609 + miR.520f + miR.29a 0.75 0.348153894miR.603 + miR.520f + miR.518c 0.74 0.425658902 miR.609 + miR.29a +miR.376a* 0.74 0.194993588 miR.609 + miR.220a + miR.518c 0.740.049347643 miR.558 + miR.220a + miR.518c 0.74 0.101338262 miR.603 +miR.376a* + miR.518c 0.74 0.346484887 miR.558 + miR.609 + miR.520f 0.740.140417039 miR.609 + miR.518c + miR.639 0.74 0.351186289 miR.603 +miR.518c + miR.639 0.74 0.280054707 miR.609 + miR.130a + miR.518c 0.740.449352384 miR.520f + miR.220a + miR.518c 0.74 0.402122181 miR.603 +miR.369.3p + miR.518c 0.74 0.273671635 miR.558 + miR.609 + miR.603 0.730.108306893 miR.603 + miR.362 + miR.518c 0.73 0.293305717 miR.520f +miR.518c + miR.639 0.73 0.35243061 miR.609 + miR.520f + miR.518c 0.730.30176526 miR.603 + miR.29a + miR.518c 0.73 0.271112606 miR.603 +miR.26a + miR.518c 0.73 0.285703084 miR.558 + miR.376a* + miR.518c 0.730.315129807 miR.558 + miR.609 + miR.639 0.73 0.104170851 miR.609 +miR.520f + miR.130a 0.73 0.370027972 miR.603 + miR.518c + miR.660 0.730.216991425 miR.603 + miR.130a + miR.518c 0.73 0.251376103 miR.603 +miR.518c + miR.338 0.73 0.212164512 miR.603 + miR.519b + miR.518c 0.730.185914027 miR.558 + miR.609 + miR.130a 0.73 0.078091571 miR.603 +miR.494 + miR.518c 0.73 0.173052451 miR.558 + miR.362 + miR.518c 0.730.069189409 miR.558 + miR.609 + miR.220a 0.73 0.039602125 miR.558 +miR.609 + miR.362 0.73 0.021740781 miR.609 + miR.603 + miR.29a 0.730.397990999 miR.520f + miR.29a + miR.518c 0.73 0.404704361 miR.558 +miR.518c + miR.639 0.73 0.091698305 miR.558 + miR.26a + miR.518c 0.730.299248291 miR.558 + miR.29a + miR.518c 0.73 0.09574238 miR.609 +miR.519b + miR.518c 0.73 0.005919178 miR.558 + miR.609 + miR.369.3p 0.730.265320988 miR.609 + miR.29a + miR.494 0.73 0.329298298 miR.609 +miR.220a + miR.29a 0.73 0.471997025 miR.609 + miR.362 + miR.518c 0.730.256139437 miR.558 + miR.369.3p + miR.518c 0.73 0.153094875 miR.558 +miR.519b + miR.518c 0.73 0.202589552 miR.558 + miR.518c + miR.660 0.730.090211228 miR.609 + miR.520f + miR.639 0.73 0.248436815 miR.520f +miR.26a + miR.518c 0.73 0.248670032 miR.558 + miR.494 + miR.518c 0.730.102215116 miR.558 + miR.609 + miR.494 0.73 0.112580737 miR.558 +miR.518c + miR.338 0.73 0.111295798 miR.558 + miR.130a + miR.518c 0.730.097771847 miR.609 + miR.369.3p + miR.518c 0.73 0.292047668 miR.520f +miR.130a + miR.518c 0.73 0.325326497 miR.558 + miR.609 + miR.376a* 0.730.260189737 miR.609 + miR.494 + miR.518c 0.73 0.098487012 miR.609 +miR.29a + miR.369.3p 0.72 0.335139361 miR.558 + miR.609 + miR.660 0.720.025079336 miR.609 + miR.26a + miR.29a 0.72 0.43507738 miR.609 +miR.519b + miR.29a 0.72 0.332887111 miR.609 + miR.29a + miR.639 0.720.363228171 miR.520f + miR.519b + miR.518c 0.72 0.170474636 miR.609 +miR.29a + miR.338 0.72 0.321558317 miR.220a + miR.518c + miR.338 0.720.178086869 miR.220a + miR.29a + miR.518c 0.72 0.137410978 miR.609 +miR.29a + miR.362 0.72 0.37955572 miR.220a + miR.369.3p + 0.720.153896555 miR.518c miR.609 + miR.29a + miR.660 0.72 0.284984411miR.558 + miR.609 + miR.26a 0.72 0.057440468 miR.220a + miR.518c +miR.639 0.72 0.125459545 miR.520f + miR.362 + miR.518c 0.72 0.301355412miR.609 + miR.520f + miR.26a 0.72 0.312363545 miR.558 + miR.609 +miR.338 0.72 0.047008735 miR.609 + miR.603 + miR.130a 0.72 0.23533357miR.609 + miR.130a + miR.29a 0.72 0.370784436 miR.220a + miR.362 +miR.518c 0.72 0.16166902 miR.609 + miR.518c + miR.660 0.72 0.112066562miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.72 0.198135987 miR.220a + miR.130a +miR.518c 0.72 0.148439546 miR.558 + miR.609 + miR.519b 0.72 0.088041913miR.220a + miR.26a + miR.518c 0.72 0.190004241 miR.220a + miR.519b +miR.518c 0.72 0.142304577 miR.220a + miR.494 + miR.518c 0.72 0.157006033miR.220a + miR.518c + miR.660 0.72 0.161323893 miR.609 + miR.603 +miR.494 0.72 0.241519739 miR.609 + miR.603 + miR.639 0.72 0.251517332miR.609 + miR.26a + miR.518c 0.72 0.066030989 miR.558 + miR.603 +miR.520f 0.72 0.142937829 miR.520f + miR.518c + miR.660 0.72 0.243462668miR.558 + miR.520f + miR.29a 0.72 0.061445518 miR.520f + miR.369.3p +0.72 0.221082215 miR.518c miR.520f + miR.518c + miR.338 0.72 0.277129663miR.609 + miR.362 + miR.369.3p 0.72 0.256027229 miR.609 + miR.603 +miR.520f 0.72 0.165161932 miR.558 + miR.520f + miR.639 0.72 0.10668753miR.609 + miR.518c + miR.338 0.72 0.049918113 miR.609 + miR.130a +miR.376a* 0.72 0.314938145 miR.520f + miR.494 + miR.518c 0.720.161170186 miR.609 + miR.603 + miR.220a 0.72 0.17485756 miR.609 +miR.376a* + miR.518c 0.71 0.021158932 miR.558 + miR.520f + miR.362 0.710.042970193 miR.609 + miR.220a + miR.130a 0.71 0.128890701 miR.609 +miR.603 + miR.369.3p 0.71 0.196936889 miR.609 + miR.520f + miR.494 0.710.067113092 miR.558 + miR.520f + miR.130a 0.71 0.032963824 miR.609 +miR.362 + miR.494 0.71 0.132878392 miR.609 + miR.520f + miR.220a 0.710.044047133 miR.609 + miR.603 + miR.362 0.71 0.081082555 miR.558 +miR.520f + miR.26a 0.71 0.037521396 miR.609 + miR.494 + miR.639 0.710.073255244 miR.609 + miR.220a + miR.494 0.71 0.17258061 miR.609 +miR.220a + miR.369.3p 0.71 0.105201478 miR.558 + miR.520f + miR.338 0.710.064777816 miR.609 + miR.520f + miR.362 0.71 0.035840094 miR.558 +miR.520f + miR.660 0.71 0.043413436 miR.558 + miR.362 + miR.369.3p 0.710.037425892 miR.558 + miR.603 + miR.362 0.71 0.043710943 miR.609 +miR.603 + miR.376a* 0.71 0.128251061 miR.609 + miR.220a + miR.376a* 0.710.080434388 miR.558 + miR.603 + miR.29a 0.71 0.050887026 miR.609 +miR.130a + miR.369.3p 0.71 0.097832454 miR.609 + miR.130a + miR.494 0.710.07652331 miR.609 + miR.603 + miR.660 0.71 0.069081805 miR.609 +miR.603 + miR.26a 0.71 0.119585833 miR.609 + miR.220a + miR.362 0.710.050963096 miR.609 + miR.603 + miR.519b 0.71 0.070308772 miR.558 +miR.603 + miR.130a 0.71 0.028731659 miR.558 + miR.603 + miR.369.3p 0.710.051261759 miR.558 + miR.603 + miR.639 0.71 0.034357969 miR.558 +miR.520f + miR.494 0.71 0.048911277 miR.603 + miR.520f + miR.29a 0.710.216340461 miR.558 + miR.603 + miR.660 0.71 0.027394144 miR.609 +miR.520f + miR.519b 0.71 0.033679188 miR.609 + miR.520f + miR.338 0.70.052551862 miR.603 + miR.362 + miR.369.3p 0.7 0.198969083 miR.558 +miR.520f + miR.220a 0.7 0.044708648 miR.603 + miR.520f + miR.639 0.70.167994772 miR.609 + miR.603 + miR.338 0.7 0.084883885 miR.603 +miR.520f + miR.130a 0.7 0.141242618 miR.609 + miR.520f + miR.660 0.70.016329201 miR.609 + miR.369.3p + miR.494 0.7 0.049507017 miR.558 +miR.520f + miR.369.3p 0.7 0.128349981 miR.609 + miR.520f + miR.369.3p0.7 0.056625869 miR.362 + miR.369.3p + miR.518c 0.7 0.240334825miR.558 + miR.603 + miR.494 0.7 0.021795267 miR.519b + miR.518c +miR.639 0.7 0.007041137 miR.603 + miR.520f + miR.26a 0.7 0.181375394miR.609 + miR.519b + miR.362 0.7 0.017616618 miR.609 + miR.26a + miR.3620.7 0.049968858 miR.609 + miR.220a + miR.519b 0.7 0.027688308 miR.558 +miR.603 + miR.220a 0.7 0.04012403 miR.519b + miR.362 + miR.518c 0.70.026035969 miR.603 + miR.520f + miR.494 0.7 0.119510911 miR.519b +miR.376a* + miR.518c 0.7 0.007101906 miR.558 + miR.520f + miR.376a* 0.70.148510611 miR.519b + miR.369.3p + 0.7 0.006727401 miR.518c miR.609 +miR.362 + miR.376a* 0.7 0.065078334 miR.558 + miR.520f + miR.519b 0.70.159181427 miR.519b + miR.29a + miR.518c 0.7 0.025523668 miR.603 +miR.520f + miR.362 0.7 0.142734333 miR.609 + miR.362 + miR.338 0.70.039368124 miR.603 + miR.362 + miR.494 0.7 0.09934405 miR.609 +miR.494 + miR.660 0.7 0.041673346 miR.558 + miR.29a + miR.362 0.70.004731426 miR.609 + miR.520f + miR.376a* 0.7 0.020124337 miR.558 +miR.362 + miR.494 0.7 0.003012638 miR.520f + miR.29a + miR.362 0.70.089888022 miR.558 + miR.603 + miR.338 0.7 0.015964208 miR.519b +miR.130a + miR.518c 0.7 0.00436048 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miR.26a + miR.494 0.69 0.037334593 miR.520f +miR.519b + miR.639 0.69 0.032303599 miR.520f + miR.29a + miR.376a* 0.690.135732892 miR.558 + miR.220a + miR.362 0.69 0.004264036 miR.520f +miR.26a + miR.362 0.69 0.080410499 miR.362 + miR.494 + miR.518c 0.690.07811005 miR.558 + miR.220a + miR.29a 0.69 0.003817785 miR.603 +miR.130a + miR.362 0.69 0.107693542 miR.520f + miR.362 + miR.369.3p 0.690.064838129 miR.603 + miR.520f + miR.369.3p 0.69 0.097355846 miR.603 +miR.520f + miR.338 0.69 0.083688787 miR.609 + miR.376a* + miR.660 0.690.030919011 miR.558 + miR.29a + miR.369.3p 0.69 0.008209665 miR.603 +miR.220a + miR.494 0.69 0.09413129 miR.603 + miR.362 + miR.639 0.690.092399431 miR.603 + miR.494 + miR.639 0.69 0.037277169 miR.603 +miR.29a + miR.362 0.69 0.097411564 miR.558 + miR.362 + miR.338 0.690.001934736 miR.558 + miR.29a + miR.494 0.69 0.002735141 miR.558 +miR.29a + miR.639 0.69 0.00511974 miR.558 + miR.362 + miR.376a* 0.690.004511201 miR.520f + miR.362 + miR.494 0.69 0.026077672 miR.520f 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+miR.376a* + miR.660 0.68 0.062752031 miR.520f + miR.362 + miR.376a* 0.680.037891073 miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.68 0.026641203 miR.603 +miR.376a* + miR.639 0.68 0.062767214 miR.558 + miR.130a + miR.338 0.680.001298161 miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.68 0.015993401 miR.603 +miR.639 + miR.338 0.68 0.038471506 miR.558 + miR.519b + miR.130a 0.680.001359148 miR.603 + miR.26a + miR.639 0.68 0.036012679 miR.220a +miR.362 + miR.494 0.68 0.021666565 miR.520f + miR.369.3p + miR.494 0.680.01293201 miR.362 + miR.369.3p + 0.68 0.047295371 miR.376a* miR.603 +miR.26a + miR.369.3p 0.68 0.041274316 miR.603 + miR.519b + miR.660 0.680.042202556 miR.603 + miR.220a + miR.26a 0.67 0.050004442 miR.362 +miR.369.3p + miR.639 0.67 0.042589232 miR.603 + miR.369.3p + miR.3380.67 0.037912775 miR.603 + miR.369.3p + 0.67 0.056124246 miR.376a*miR.603 + miR.220a + miR.519b 0.67 0.046039626 miR.603 + miR.660 +miR.338 0.67 0.032875331 miR.603 + miR.26a + miR.660 0.67 0.034332136miR.603 + miR.220a + miR.338 0.67 0.045592948 miR.558 + miR.376a* +miR.494 0.67 0.01210817 miR.369.3p + miR.494 + miR.518c 0.67 0.00381182miR.558 + miR.369.3p + miR.338 0.67 0.012678172 miR.29a + miR.362 +miR.369.3p 0.67 0.051664943 miR.130a + miR.362 + miR.369.3p 0.670.041646443 miR.29a + miR.518c + miR.660 0.67 0.014200948 miR.603 +miR.220a + miR.376a* 0.67 0.063739599 miR.220a + miR.29a + miR.494 0.670.010435825 miR.220a + miR.29a + miR.362 0.67 0.013267597 miR.130a +miR.369.3p + 0.67 0.013797868 miR.518c miR.130a + miR.494 + miR.518c0.67 0.003426413 miR.220a + miR.29a + miR.369.3p 0.67 0.010805745miR.520f + miR.376a* + miR.660 0.67 0.023277242 miR.220a + miR.130a +miR.362 0.67 0.015581923 miR.220a + miR.362 + miR.639 0.67 0.008960577miR.220a + miR.26a + miR.29a 0.67 0.015919194 miR.519b + miR.29a +miR.362 0.66 0.007917993 miR.220a + miR.29a + miR.338 0.66 0.006269301miR.220a + miR.29a + miR.639 0.66 0.013210616 miR.220a + miR.519b +miR.29a 0.66 0.006033479 miR.603 + miR.519b + miR.26a 0.66 0.016181215miR.519b + miR.130a + miR.362 0.66 0.0029988 miR.220a + miR.130a + 0.660.004916638 miR.369.3p miR.220a + miR.29a + miR.660 0.66 0.009183359miR.26a + miR.369.3p + miR.518c 0.66 0.009051473 miR.220a + miR.130a +miR.29a 0.66 0.007773035 miR.220a + miR.29a + miR.376a* 0.66 0.02391839miR.369.3p + miR.518c + miR.338 0.66 0.008593343 miR.603 + miR.26a +miR.338 0.66 0.017783329 miR.220a + miR.369.3p + miR.639 0.66 0.00521421miR.519b + miR.26a + miR.29a 0.66 0.002257527 miR.519b + miR.29a +miR.494 0.66 0.001399685 miR.519b + miR.29a + miR.369.3p 0.660.003631973 miR.603 + miR.26a + miR.376a* 0.66 0.022188973 miR.220a +miR.26a + miR.362 0.66 0.004094142 miR.220a + miR.362 + miR.338 0.660.004256069 miR.519b + miR.29a + miR.639 0.66 0.001554 miR.220a +miR.362 + miR.376a* 0.66 0.009279042 miR.603 + miR.376a* + miR.338 0.660.032502963 miR.29a + miR.362 + miR.639 0.66 0.008171297 miR.220a +miR.130a + miR.639 0.66 0.001492459 miR.220a + miR.519b + miR.130a 0.660.000761264 miR.220a + miR.130a + miR.660 0.66 0.002601161 miR.519b +miR.29a + miR.376a* 0.66 0.007472073 miR.519b + miR.130a + miR.29a 0.650.001009144 miR.519b + miR.29a + miR.660 0.65 0.001366399 miR.220a +miR.130a + miR.376a* 0.65 0.005951799 miR.220a + miR.130a + miR.26a 0.650.000508695 miR.519b + miR.130a + miR.376a* 0.65 0.000560668 miR.220a +miR.130a + miR.338 0.65 0.000874004 miR.130a + miR.29a + miR.362 0.650.005112882

TABLE 4 clusters of 4 miRNAs pv compared to top signature miR.609 +miR.29a + c_tau miR.376a* + Cluster of 4 miRs level miR.518c miR.609 +miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.77 NaN miR.558 + miR.609 + miR.29a +miR.518c 0.77 0.095190878 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.376a* 0.770.234133564 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.398192778miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.518c 0.77 0.152400827 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.518c 0.77 0.273655288 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.518c 0.77 0.120996525 miR.558 + miR.609 + miR.518c +miR.639 0.76 0.083980327 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.518c 0.760.090562295 miR.558 + miR.609 + miR.376a* + miR.518c 0.76 0.073563814miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a 0.76 0.212166867 miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.518c 0.76 0.069410938 miR.558 + miR.609 +miR.369.3p + miR.518c 0.76 0.073717701 miR.558 + miR.609 + miR.362 +miR.518c 0.76 0.050881463 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.518c 0.760.071838125 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.518c 0.76 0.101227072miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.518c 0.76 0.05942434 miR.558 +miR.603 + miR.220a + miR.518c 0.76 0.131622103 miR.558 + miR.609 +miR.519b + miR.518c 0.76 0.041357661 miR.609 + miR.520f + miR.518c +miR.639 0.76 0.147820503 miR.558 + miR.609 + miR.494 + miR.518c 0.760.059097293 miR.603 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.76 0.251129292miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.518c 0.76 0.061349034 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.518c 0.76 0.195773827 miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.518c 0.76 0.116815227 miR.558 + miR.609 + miR.518c +miR.338 0.76 0.05045062 miR.558 + miR.609 + miR.518c + miR.660 0.760.039220441 miR.609 + miR.603 + miR.518c + miR.639 0.76 0.071585762miR.558 + miR.603 + miR.376a* + miR.518c 0.76 0.202745975 miR.609 +miR.603 + miR.376a* + miR.518c 0.76 0.084566847 miR.609 + miR.29a +miR.518c + miR.660 0.76 0.006818281 miR.609 + miR.26a + miR.29a +miR.518c 0.76 0.033615265 miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.518c 0.760.064304505 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.518c 0.76 0.073345843miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a 0.75 0.07199124 miR.609 +miR.29a + miR.518c + miR.338 0.75 0.043991625 miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.376a* 0.75 0.275240376 miR.558 + miR.603 + miR.519b +miR.518c 0.75 0.145532044 miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* 0.750.092195252 miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.494 0.75 0.268412151miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.05151607 miR.558 +miR.520f + miR.518c + miR.639 0.75 0.160078581 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.639 0.75 0.153716109 miR.609 + miR.603 + miR.29a +miR.376a* 0.75 0.121083107 miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.518c 0.750.122942194 miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.518c 0.75 0.182075349miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a 0.75 0.219179588 miR.558 +miR.603 + miR.26a + miR.518c 0.75 0.15839003 miR.609 + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* 0.75 0.213298508 miR.603 + miR.220a +miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.126725345 miR.558 + miR.603 + miR.518c +miR.639 0.75 0.159516149 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.518c 0.750.154099639 miR.609 + miR.603 + miR.494 + miR.518c 0.75 0.094774889miR.609 + miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.75 0.042714709 miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.518c 0.75 0.033957969 miR.558 + miR.603 +miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.139052213 miR.609 + miR.29a + miR.369.3p +miR.518c 0.75 0.02790735 miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.518c 0.750.026540884 miR.603 + miR.220a + miR.518c + miR.338 0.75 0.109761825miR.558 + miR.520f + miR.29a + miR.518c 0.75 0.169971614 miR.558 +miR.603 + miR.362 + miR.518c 0.75 0.125790751 miR.609 + miR.130a +miR.29a + miR.518c 0.75 0.017242261 miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.518c 0.75 0.090332806 miR.558 + miR.603 + miR.29a + miR.518c 0.750.137256379 miR.603 + miR.520f + miR.518c + miR.639 0.75 0.155894054miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.518c 0.75 0.105622688 miR.558 +miR.603 + miR.494 + miR.518c 0.75 0.120489954 miR.558 + miR.520f +miR.376a* + miR.518c 0.75 0.193976453 miR.558 + miR.603 + miR.518c +miR.338 0.75 0.125210123 miR.609 + miR.603 + miR.362 + miR.518c 0.750.051557056 miR.609 + miR.29a + miR.518c + miR.639 0.75 0.025353784miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.518c 0.75 0.034932887 miR.558 +miR.603 + miR.518c + miR.660 0.75 0.120602125 miR.603 + miR.220a +miR.518c + miR.639 0.75 0.089640403 miR.609 + miR.29a + miR.362 +miR.518c 0.75 0.022807144 miR.609 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.750.015135288 miR.558 + miR.603 + miR.130a + miR.518c 0.75 0.128050808miR.609 + miR.220a + miR.518c + miR.639 0.75 0.019525674 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.29a 0.75 0.11995271 miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.518c 0.75 0.101475598 miR.609 + miR.520f + miR.26a +miR.518c 0.75 0.091970396 miR.603 + miR.220a + miR.494 + miR.518c 0.750.102280329 miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.518c 0.75 0.033387808miR.558 + miR.520f + miR.362 + miR.518c 0.75 0.17757916 miR.558 +miR.520f + miR.130a + miR.518c 0.75 0.164603281 miR.609 + miR.603 +miR.518c + miR.338 0.75 0.040306705 miR.603 + miR.520f + miR.376a* +miR.518c 0.75 0.178218301 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.660 0.750.108259038 miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.518c 0.75 0.049760274miR.603 + miR.220a + miR.362 + miR.518c 0.75 0.084267929 miR.603 +miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.75 0.110692495 miR.558 + miR.609 +miR.29a + miR.660 0.75 0.062339195 miR.609 + miR.603 + miR.518c +miR.660 0.75 0.03753584 miR.558 + miR.520f + miR.519b + miR.518c 0.750.140569368 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.376a* 0.75 0.155334179miR.603 + miR.220a + miR.518c + miR.660 0.75 0.086588446 miR.609 +miR.519b + miR.29a + miR.376a* 0.75 0.083277641 miR.558 + miR.609 +miR.376a* + miR.639 0.75 0.130880406 miR.558 + miR.220a + miR.376a* +miR.518c 0.75 0.108015506 miR.558 + miR.520f + miR.26a + miR.518c 0.750.15060931 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a 0.75 0.099431509miR.558 + miR.520f + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.145736289 miR.558 +miR.520f + miR.494 + miR.518c 0.75 0.122357549 miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.494 0.75 0.172325158 miR.558 + miR.609 + miR.29a +miR.369.3p 0.75 0.09238121 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a 0.750.072519142 miR.609 + miR.220a + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.020967329miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.518c 0.75 0.151377195 miR.558 +miR.520f + miR.518c + miR.338 0.75 0.150058461 miR.558 + miR.520f +miR.518c + miR.660 0.75 0.132520189 miR.603 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c 0.75 0.179261881 miR.609 + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.750.043347291 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.338 0.75 0.06854081miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a 0.75 0.156943535 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a 0.75 0.095775145 miR.558 + miR.609 +miR.519b + miR.29a 0.75 0.061975286 miR.558 + miR.609 + miR.29a +miR.639 0.75 0.076366259 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.494 0.750.103217378 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f 0.75 0.170065251miR.558 + miR.220a + miR.26a + miR.518c 0.75 0.062062634 miR.609 +miR.29a + miR.376a* + miR.639 0.75 0.045578904 miR.609 + miR.220a +miR.494 + miR.518c 0.75 0.026701873 miR.609 + miR.29a + miR.362 +miR.376a* 0.75 0.05758252 miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a 0.750.071806723 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a 0.75 0.066879617miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p 0.75 0.105980196 miR.603 +miR.520f + miR.130a + miR.518c 0.75 0.146050405 miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.338 0.75 0.084787236 miR.609 + miR.520f + miR.29a +miR.639 0.75 0.105287948 miR.603 + miR.520f + miR.369.3p + miR.518c 0.750.15502797 miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.74 0.095638325miR.609 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.74 0.037647912 miR.603 +miR.520f + miR.362 + miR.518c 0.74 0.128652026 miR.558 + miR.609 +miR.29a + miR.362 0.74 0.073016857 miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.518c 0.74 0.116485645 miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a 0.740.11856521 miR.609 + miR.519b + miR.518c + miR.639 0.74 0.01994205miR.558 + miR.220a + miR.519b + miR.518c 0.74 0.053231829 miR.609 +miR.520f + miR.26a + miR.29a 0.74 0.103809182 miR.603 + miR.520f +miR.26a + miR.518c 0.74 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+ miR.639 0.730.069677371 miR.558 + miR.29a + miR.518c + miR.338 0.73 0.023717845miR.558 + miR.130a + miR.362 + miR.518c 0.73 0.033933391 miR.558 +miR.609 + miR.369.3p + miR.494 0.73 0.09121593 miR.609 + miR.603 +miR.130a + miR.29a 0.73 0.03420256 miR.520f + miR.26a + miR.29a +miR.518c 0.73 0.067269802 miR.520f + miR.29a + miR.518c + miR.338 0.730.076669475 miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.29a 0.73 0.028546438miR.609 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c 0.73 0.028830831 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.362 0.73 0.038229586 miR.558 + miR.494 +miR.518c + miR.639 0.73 0.032661435 miR.558 + miR.519b + miR.29a +miR.518c 0.73 0.033339954 miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.494 0.730.056013402 miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.73 0.08584984miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.376a* 0.73 0.045281352 miR.520f +miR.130a + miR.29a + miR.518c 0.73 0.08778147 miR.609 + miR.220a +miR.26a + miR.29a 0.73 0.011664266 miR.609 + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* 0.73 0.148943316 miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p0.73 0.024156115 miR.558 + miR.26a + miR.494 + miR.518c 0.73 0.054062325miR.558 + miR.518c + miR.639 + miR.660 0.73 0.038428075 miR.609 +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p 0.73 0.040814635 miR.609 + miR.603 +miR.29a + miR.362 0.73 0.034280118 miR.558 + miR.609 + miR.369.3p +miR.660 0.73 0.068825487 miR.609 + miR.29a + miR.494 + miR.338 0.730.026047031 miR.558 + miR.26a + miR.518c + miR.338 0.73 0.055344824miR.558 + miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.73 0.022491443 miR.609 +miR.519b + miR.518c + miR.660 0.73 0.00782303 miR.520f + miR.29a +miR.494 + miR.518c 0.73 0.078245802 miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.660 0.73 0.006263507 miR.558 + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.730.046525542 miR.558 + miR.609 + miR.369.3p + miR.338 0.73 0.086904488miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.494 0.73 0.054141582 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.494 0.73 0.104015054 miR.609 + miR.520f +miR.362 + miR.639 0.73 0.072460936 miR.609 + miR.520f + miR.639 +miR.338 0.73 0.074374157 miR.609 + miR.29a + miR.494 + miR.639 0.730.042566365 miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.518c 0.73 0.006647307miR.520f + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.73 0.04859414 miR.609 +miR.519b + miR.518c + miR.338 0.73 0.006807561 miR.609 + miR.220a +miR.29a + miR.338 0.73 0.015999341 miR.609 + miR.519b + miR.29a +miR.494 0.73 0.040745552 miR.558 + miR.29a + miR.518c + miR.660 0.730.030602068 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.369.3p 0.73 0.081066424miR.609 + miR.519b + miR.130a + miR.376a* 0.73 0.060025821 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.369.3p 0.73 0.077410062 miR.558 + miR.519b +miR.369.3p + miR.518c 0.73 0.053466843 miR.609 + miR.26a + miR.362 +miR.518c 0.73 0.009256496 miR.609 + miR.369.3p + miR.518c + miR.660 0.730.010362334 miR.558 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c 0.73 0.042544066miR.558 + miR.519b + miR.518c + miR.660 0.73 0.033810946 miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.639 0.73 0.057658231 miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.518c 0.73 0.043576783 miR.609 + miR.362 + miR.376a* +miR.518c 0.73 0.003926436 miR.520f + miR.362 + miR.369.3p + miR.518c0.73 0.07167175 miR.558 + miR.369.3p + miR.518c + miR.338 0.730.03659566 miR.220a + miR.518c + miR.639 + miR.338 0.73 0.008625653miR.520f + miR.26a + miR.362 + miR.518c 0.73 0.042129104 miR.609 +miR.603 + miR.362 + miR.369.3p 0.73 0.066110609 miR.520f + miR.130a +miR.362 + miR.518c 0.73 0.066757079 miR.558 + miR.369.3p + miR.518c +miR.660 0.73 0.04576864 miR.609 + miR.362 + miR.518c + miR.660 0.730.005445028 miR.609 + miR.520f + miR.369.3p + miR.639 0.73 0.060200502miR.609 + miR.220a + miR.519b + miR.29a 0.73 0.017829862 miR.220a +miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.73 0.024536373 miR.609 + miR.220a +miR.29a + miR.639 0.73 0.017469826 miR.609 + miR.220a + miR.130a +miR.29a 0.73 0.016035157 miR.558 + miR.518c + miR.660 + miR.338 0.730.026559768 miR.220a + miR.26a + miR.369.3p + miR.518c 0.73 0.023284351miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.518c 0.73 0.049486625 miR.609 +miR.519b + miR.376a* + miR.639 0.73 0.074001601 miR.609 + miR.362 +miR.518c + miR.338 0.73 0.005669306 miR.609 + miR.494 + miR.518c +miR.660 0.73 0.017339014 miR.558 + miR.130a + miR.369.3p + miR.518c 0.730.04801593 miR.558 + miR.519b + miR.518c + miR.338 0.73 0.022642243miR.609 + miR.603 + miR.494 + miR.639 0.73 0.099375105 miR.609 +miR.519b + miR.26a + miR.29a 0.73 0.009115276 miR.558 + miR.603 +miR.520f + miR.639 0.73 0.111635217 miR.609 + miR.130a + miR.369.3p +miR.376a* 0.73 0.094334817 miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.518c 0.730.036616858 miR.558 + miR.494 + miR.518c + miR.660 0.73 0.0209133miR.558 + miR.519b + miR.494 + miR.518c 0.73 0.029778652 miR.220a +miR.369.3p + miR.518c + miR.338 0.73 0.024792375 miR.609 + miR.220a +miR.29a + miR.362 0.73 0.017908865 miR.220a + miR.130a + miR.26a +miR.518c 0.73 0.020876153 miR.609 + miR.520f + miR.639 + miR.660 0.730.055728073 miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.362 0.73 0.006368033miR.558 + miR.519b + miR.130a + miR.518c 0.73 0.027551883 miR.558 +miR.609 + miR.494 + miR.660 0.73 0.065683851 miR.609 + miR.603 +miR.130a + miR.369.3p 0.73 0.058944345 miR.220a + miR.26a + miR.518c +miR.639 0.73 0.01481234 miR.609 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.730.014701023 miR.520f + miR.26a + miR.369.3p + miR.518c 0.73 0.034621629miR.520f + miR.26a + miR.518c + miR.660 0.73 0.029220716 miR.609 +miR.519b + miR.29a + miR.369.3p 0.73 0.023972747 miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.130a 0.73 0.034829252 miR.558 + miR.130a + miR.518c +miR.660 0.73 0.030952624 miR.220a + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.730.028758485 miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.639 0.73 0.007463068miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p 0.73 0.015898228 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.494 0.73 0.068523648 miR.520f + miR.26a +miR.494 + miR.518c 0.73 0.044919939 miR.520f + miR.519b + miR.362 +miR.518c 0.73 0.048769905 miR.520f + miR.26a + miR.518c + miR.338 0.730.029715495 miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.376a* 0.73 0.077237275miR.558 + miR.609 + miR.494 + miR.338 0.73 0.077101971 miR.609 +miR.26a + miR.494 + miR.518c 0.73 0.017895554 miR.558 + miR.603 +miR.520f + miR.29a 0.73 0.109254688 miR.609 + miR.376a* + miR.494 +miR.639 0.73 0.136796764 miR.520f + miR.130a + miR.369.3p + miR.518c0.73 0.054306405 miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.494 0.73 0.066990008miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.338 0.73 0.012834623

TABLE 5 clusters of 5 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +c_tau miR.609 + miR.29a + Cluster of 5 miRs level miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 NaN miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.327442837 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* 0.79 0.327799124 miR.609 +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.01115903 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.450779905 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.518c 0.78 0.059817433 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.518c 0.78 0.043671541 miR.558 +miR.609 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.78 0.23022043 miR.609 +miR.519b + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.188539884 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.518c + miR.660 0.78 0.002653657 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.494 0.78 0.249066295 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* 0.78 0.158036688 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.518c + miR.639 0.78 0.063513262 miR.609 +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.143839599 miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.110267568 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.035625688 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.518c + miR.660 0.78 0.067617987 miR.609 +miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.77 0.350446224 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.518c 0.77 0.016877074 miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.041540235 miR.609 +miR.603 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.77 0.026897842 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.017879839 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.518c 0.77 0.006280085 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.518c + miR.338 0.77 0.011101684 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.494 0.77 0.062612995 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.518c 0.77 0.03443809 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.033997596 miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.518c 0.77 0.002887257 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0.157501218 miR.609 +miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.231742772 miR.609 +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.185874123 miR.609 +miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.192784408 miR.609 +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.77 0.133790333 miR.609 +miR.130a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.174916686 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.031799615 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.77 0.005160508 miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.04671063 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.518c 0.77 0.099573877 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.37830202 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.518c 0.77 0.028220566 miR.558 +miR.603 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.03980927 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.518c 0.77 0.007674366 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.518c 0.77 0.004377824 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.518c + miR.639 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+miR.520f + miR.26a + miR.376a* + miR.494 0.75 0.076045797 miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.518c + miR.660 0.75 0.017343411 miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.518c + miR.660 0.75 0.001581982 miR.558 +miR.603 + miR.26a + miR.518c + miR.660 0.75 0.027131535 miR.558 +miR.520f + miR.29a + miR.518c + miR.639 0.75 0.019640508 miR.609 +miR.130a + miR.29a + miR.518c + miR.639 0.75 0.001080999 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.369.3p 0.75 0.053459123 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.639 0.75 0.053286342 miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.518c + miR.660 0.75 0.022335483 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.130a 0.75 0.064845424 miR.558 +miR.520f + miR.362 + miR.376a* + miR.518c 0.75 0.045030008 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.639 0.75 0.041778052 miR.609 +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.002486241 miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.660 0.75 0.044235947 miR.603 +miR.220a + miR.369.3p + miR.518c + miR.639 0.75 0.011980221 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.362 0.75 0.027438706 miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.010519744 miR.609 +miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.00214254 miR.558 +miR.520f + miR.220a + miR.494 + miR.518c 0.75 0.012772203 miR.609 +miR.519b + miR.29a + miR.376a* + miR.639 0.75 0.015007279 miR.609 +miR.603 + miR.369.3p + miR.518c + miR.660 0.75 0.00793125 miR.558 +miR.603 + miR.494 + miR.518c + miR.639 0.75 0.005636393 miR.603 +miR.520f + miR.26a + miR.376a* + miR.518c 0.75 0.024421876 miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.518c 0.75 0.010530365 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.338 0.75 0.046884652 miR.558 +miR.520f + miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.75 0.017713046 miR.603 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.75 0.030292073 miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.494 + miR.518c 0.75 0.020658815 miR.558 +miR.520f + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.75 0.088750924 miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.369.3p + miR.518c 0.75 0.002238117 miR.558 +miR.603 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c 0.75 0.01247287 miR.609 +miR.603 + miR.362 + miR.494 + miR.518c 0.75 0.014175895 miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.362 + miR.518c 0.75 0.013147374 miR.609 +miR.29a + miR.494 + miR.518c + miR.639 0.75 0.001660365 miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.518c 0.75 0.019222776 miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.75 0.019991243 miR.558 +miR.603 + miR.26a + miR.518c + miR.338 0.75 0.023494384 miR.558 +miR.603 + miR.29a + miR.518c + miR.338 0.75 0.006133672

TABLE 6 clusters of 6miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + c_tau miR.220a + miR.29a + Cluster of 6 miRs level miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c0.8 NaN miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c0.8 0.425262874 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* +miR.518c 0.8 0.000198569 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c 0.8 0.192669487 miR.558 + miR.609 + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.8 0.357087852 miR.558 + miR.609 +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.79 0.185758947 miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.462031556miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.790.100722966 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.3380.79 0.176804634 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.376a* +miR.518c 0.79 0.132965668 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.362 +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.112793246 miR.558 + miR.609 + miR.519b +miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.131995208 miR.558 + miR.609 +miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.79 0.292038462 miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.495842065miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.790.164096863 miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c 0.79 0.109937592 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.465866529 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.376a* + miR.338 0.79 0.24024849 miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.79 0.362228462 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.518c + miR.660 0.79 0.061409925miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.494 0.790.098769582 miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c0.79 0.062376144 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* 0.79 0.260005036 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.496052539 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.79 0.267576326 miR.609 + miR.603 +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.79 0.011245226 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.518c + miR.660 0.79 0.04047064miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.790.103974742 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c +miR.660 0.79 0.266209089 miR.609 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.454399121 miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.79 0.422773766 miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.79 0.488487745 miR.609 +miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.221080827miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* 0.790.086973376 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.6600.79 0.15681019 miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a + miR.376a* +miR.518c 0.79 0.007221034 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.111580627 miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.465457785 miR.609 + miR.603 +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.002216649 miR.609 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.488707209miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.790.002116363 miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.29a + miR.376a* +miR.518c 0.79 0.004761298 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.309625965 miR.609 + miR.520f + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.361650132 miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.79 0.26767295 miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.79 0.009226262miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.639 0.790.120239833 miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c +miR.338 0.79 0.39600383 miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.003518071 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.519b + miR.29a + miR.376a* 0.79 0.131613028 miR.609 + miR.220a +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.79 0.293581541 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.79 0.277735408miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.790.409188251 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a +miR.376a* 0.79 0.123312922 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.376a* + miR.518c 0.79 0.093728469 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.26a + miR.29a + miR.376a* 0.79 0.105948702 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* 0.78 0.115738585 miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.479361199miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.376a* 0.780.129581995 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.376a* +miR.518c 0.78 0.027048087 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.26a +miR.29a + miR.518c 0.78 0.017201072 miR.558 + miR.609 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.78 0.268171173 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.071004976 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.037830085miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.518c 0.780.018586641 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.518c0.78 0.023669412 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c +miR.639 0.78 0.146858934 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.376a* + miR.518c 0.78 0.029015602 miR.558 + miR.609 + miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.518c 0.78 0.018300028 miR.609 + miR.519b +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.424917376 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.78 0.022564996miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.780.088380038 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.518c + miR.3380.78 0.015998239 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.518c +miR.338 0.78 0.023785496 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a +miR.518c + miR.660 0.78 0.001551724 miR.558 + miR.609 + miR.130a 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miR.29a +miR.369.3p + miR.518c 0.78 0.010237864 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.78 0.009486224 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.518c + miR.660 0.78 0.006453536 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* 0.78 0.120744206miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.780.014994735 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.518c0.78 0.021035633 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.29a +miR.518c 0.78 0.018119309 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.376a* +miR.518c + miR.639 0.78 0.028081925 miR.609 + miR.603 + miR.130a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.023330265 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.376a* + miR.518c + miR.639 0.78 0.039819944 miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.376a* + miR.518c 0.78 0.040364078miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.780.147174396 miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c 0.78 0.212674547 miR.609 + miR.603 + 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miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.518c + miR.639 0.77 0.017446179 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.639 + miR.660 0.77 0.064805339 miR.558 + miR.609 +miR.519b + miR.29a + miR.376a* + miR.639 0.77 0.008827513 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.639 + miR.660 0.77 0.009735835miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.770.008170883 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.518c + miR.3380.77 0.008962688 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* +miR.660 0.77 0.002801981 miR.609 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 0.77 0.011595155 miR.609 + miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.011813893 miR.609 + miR.220a +miR.130a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.77 0.0051046 miR.603 +miR.220a + miR.130a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.07082274miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.770.011217691 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.369.3p +miR.518c 0.77 0.024556776 miR.558 + miR.609 + miR.362 + miR.518c +miR.639 + miR.660 0.77 0.068240133 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.130a + miR.518c + miR.338 0.77 0.014304072 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.004576634 miR.609 +miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* 0.77 0.093750787miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.130a + miR.518c 0.770.023536179 miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* +miR.518c 0.77 0.021357078 miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a +miR.518c + miR.660 0.77 0.002390266 miR.609 + miR.130a + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.033894424 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.518c 0.77 0.015426528 miR.609 +miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + miR.660 0.77 0.098260698miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.376a* 0.770.094345939 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.369.3p +miR.518c 0.77 0.018185215 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.018022844 miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.29a + miR.518c 0.77 0.016525501 miR.558 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.518c 0.77 0.045168349 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.518c + miR.660 0.77 0.010454011miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.518c + miR.639 0.770.04326088 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.376a*0.77 0.002518751 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.369.3p +miR.518c 0.77 0.030428094 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.011199454 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.29a + miR.376a* + miR.338 0.77 0.002040468 miR.609 + miR.130a +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.77 0.017779127 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.77 0.047455935miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.770.07847662 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.376a* + miR.518c0.77 0.00854435 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.518c 0.77 0.010617572 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.362 +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.053788243 miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.77 0.013059379 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.518c 0.77 0.016119849 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.362 + miR.369.3p + miR.518c 0.77 0.015781877miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* 0.770.079825069 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p +miR.518c 0.77 0.003692251 miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.338 0.77 0.014175499 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.519b + miR.26a + miR.518c 0.77 0.022487851 miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.660 0.77 0.093807333 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.098169323miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.770.007775701 miR.609 + miR.520f + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 0.77 0.075449122 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.01426733 miR.558 + miR.609 + miR.29a +miR.369.3p + miR.518c + miR.639 0.77 0.002316902 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.518c + miR.639 + miR.660 0.77 0.037719953 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.518c + miR.660 0.77 0.024449524miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c 0.770.0018993 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.518c + miR.3380.77 0.021836721 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.518c 0.77 0.002372279 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.051807111 miR.609 + miR.520f + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 0.77 0.043382601 miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.77 0.010569123 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.12723108miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.494 + miR.660 0.770.052610624 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.518c + miR.639 + miR.6600.77 0.023773521 miR.558 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.518c +miR.338 0.77 0.04050716 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.362 +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.008313058 miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.369.3p + miR.518c 0.77 0.013175473 miR.609 + miR.520f +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.338 0.77 0.060908541 miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* 0.77 0.0053212miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.518c 0.770.012872201 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.376a* 0.77 0.078542643 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.660 0.77 0.047264387 miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.77 0.017700054 miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.518c 0.77 0.007178292 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.518c + miR.660 0.77 0.030997545miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 0.770.019251846 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.518c0.77 0.008605824 miR.558 + miR.603 + miR.220a + miR.376a* + miR.518c +miR.660 0.77 0.029523797 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.362 + miR.376a* 0.77 0.095268033 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.519b + miR.29a + miR.376a* 0.77 0.001813366 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.362 + miR.518c 0.77 0.019808849 miR.558 +miR.609 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.77 0.13727794miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.338 0.770.136659491 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.362 + miR.518c0.77 0.020886818 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.376a* +miR.660 0.77 0.019395961 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b +miR.494 + miR.518c 0.77 0.024375379 miR.558 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.376a* + miR.518c 0.77 0.038369815 miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.518c + miR.639 0.77 0.004671713 miR.558 +miR.603 + miR.220a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c 0.77 0.021836525miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.518c + miR.338 0.770.019232048 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.494 + miR.518c0.77 0.006824784 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.362 +miR.518c 0.77 0.003863341 miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + miR.518c 0.77 0.039032708 miR.558 + miR.603 + miR.220a +miR.376a* + miR.518c + miR.338 0.77 0.02199773 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.494 + miR.518c 0.77 0.017215728 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.494 + miR.518c 0.77 0.003871226miR.603 + miR.220a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c 0.770.066129138 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.518c0.77 0.018026819 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.518c +miR.639 0.77 0.008417738 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.362 +miR.494 + miR.518c 0.77 0.001691111 miR.558 + miR.609 + miR.29a +miR.362 + miR.518c + miR.639 0.77 0.002216628 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.519b + miR.518c + miR.338 0.77 0.018574053

TABLE 7 clusters of 7 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.220aa + c_tau miR.29a + miR.369.3p + Cluster of 7 miRslevel miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 NaN miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220aa + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.025002564 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220aa + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.236514028miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c +0.8 0.234767626 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.368604402 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 4.66E−005 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.80.400443165 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.29a + miR.362 +miR.376a* + 0.8 0.063808643 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.061426174 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.220aa + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.009429917miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c +0.8 0.451228907 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.052632921 miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.220aa + miR.130a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.023756083 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.80.362771469 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a +miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.254988519 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.220aa + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.101848935 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.80.173022543 miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.022009342 miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220aa + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.014190264 miR.639miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.80.487971958 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + 0.8 0.263651262 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.21029374 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.262148524miR.518c miR.609 + miR.603 + miR.220aa + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.287440685 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.002876115 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.001233164miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c +0.8 0.275744525 miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.255194458 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.13651033 miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.80.000337044 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* +miR.518c + 0.8 0.00089689 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.000809225 miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.519b + 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miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.78 0.010372529miR.518c miR.609 + miR.520f + miR.220aa + miR.130a + miR.376a* +miR.518c + 0.78 0.02410423 miR.639 miR.609 + miR.520f + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.78 0.056627184 miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + 0.78 0.048193832miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.518c +0.78 0.004829453 miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.376a* + 0.78 0.006763588 miR.518c miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.130a + miR.362 + miR.376a* + 0.78 0.005724349 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.362 + miR.376a* + miR.518c + 0.780.065406188 miR.639 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.376a* + miR.494 + 0.78 0.006763588 miR.518c miR.609 + miR.603 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.78 0.020815213 miR.639miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.376a* + miR.518c + 0.780.00649936 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.376a* +miR.518c + 0.78 0.115075349 miR.639 miR.609 + miR.603 + miR.130a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.008293336 miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.220aa + miR.519b + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.066085896miR.639 miR.609 + miR.519b + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.78 0.033545182 miR.518c miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.78 0.043081915 miR.639 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.639 + 0.78 0.105883144miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.78 0.030516934 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.02547074 miR.518c miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.660 + 0.78 0.1747453miR.338 miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.78 0.04021298 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.130a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.079708523 miR.338 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.78 0.077941718miR.494 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +0.78 0.027716639 miR.376a* miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.130a + miR.29a + 0.78 0.021815158 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.78 0.02772778 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.494 + 0.780.009084869 miR.518c miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.071009407 miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.78 0.006328575 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.518c + 0.780.014421096 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + 0.78 0.108959907 miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + 0.78 0.028510686 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.780.066158718 miR.494 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.78 0.008922316 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.78 0.016751707 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.376a* + 0.78 0.016754078miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.518c +0.78 0.009978795 miR.639 miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + 0.78 0.025322603 miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220aa + miR.519b + miR.29a + 0.78 0.05345257 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.518c + 0.780.016788844 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a +miR.362 + 0.78 0.037161741 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220aa +miR.29a + miR.369.3p + miR.518c + 0.78 0.002872986 miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.518c + 0.78 0.012857981miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.518c +0.78 0.020261972 miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.78 0.035205989 miR.376a* miR.558 + miR.609 +miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.78 0.009225922 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.494 + 0.780.008130434 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.78 0.012928909 miR.494 miR.609 + miR.603 +miR.519b + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.0083191 miR.639miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.518c + 0.780.024292032 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + 0.78 0.022371809 miR.376a* miR.558 + miR.609 + miR.130a +miR.362 + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.034122028 miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.518c + 0.78 0.01379703miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220aa + miR.29a +0.78 0.02836698 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.362 +miR.518c + miR.639 + 0.78 0.100024182 miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.518c + 0.78 0.016907051 miR.338miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.518c + miR.639 + 0.780.013084907 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 +miR.494 + 0.78 0.011779808 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + miR.518c + 0.78 0.000728457 miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.78 0.008975345miR.518c miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.26a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.78 0.006730499 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220aa + miR.29a + miR.518c + 0.78 0.010603664 miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.220aa + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.78 0.021540479miR.376a* miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.494 +0.78 0.020102222 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a +miR.518c + miR.639 + 0.78 0.017021124 miR.338 miR.609 + miR.520f +miR.220aa + miR.130a + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.04349407 miR.338miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.494 + miR.518c + 0.780.001064546 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 +miR.518c + 0.78 0.015233262 miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.26a + miR.376a* + 0.78 0.243410022 miR.338 miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.494 + 0.78 0.113681762miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.369.3p + miR.376a* +0.78 0.04241887 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.130a +miR.29a + miR.518c + 0.78 0.000490446 miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.130a + miR.26a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.78 0.058994582 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.494 + miR.518c + 0.780.01513134 miR.338 miR.609 + miR.520f + miR.220aa + miR.29a +miR.376a* + miR.494 + 0.78 0.063917787 miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220aa + miR.29a + miR.518c + 0.78 0.007654893 miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.376a* + miR.518c + 0.780.090850124 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220aa + miR.519b + miR.29a +miR.518c + 0.78 0.004246216 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.519b +miR.130a + miR.376a* + miR.518c + 0.78 0.05677794 miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220aa + miR.29a + miR.362 + 0.78 0.018548067miR.518c miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + 0.78 0.074783771 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.369.3p + miR.518c + 0.78 0.012831826 miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.78 0.053291295miR.518c

TABLE 8 clusters of 8 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + c_tau miR.376a* +Cluster of 8 miRs level miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 NaN miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* +0.81 0.268588527 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.213114289 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.182815818miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.289192622 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.361357455miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + 0.81 0.077393148 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.122807573miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.272458791 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.431946111 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.412120313 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.44685223 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.80.055136323 miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.313798592 miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.660 + 0.8 0.489039597miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.393346155 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.482514973miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p +0.8 0.228451591 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.350771488 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.494 +0.8 0.323451407 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.8 0.371229727 miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.406008638miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.369.3p + 0.8 0.292171386 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.367581417 miR.518c +miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.231792794 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.29026386miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.294789553 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.293352698miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + 0.8 0.414989303 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.018528237 miR.639miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* +miR.518c + 0.8 0.319545984 miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.286586866 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a +miR.376a* + 0.8 0.019571018 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.031011931 miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.494 +0.8 0.119310203 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.220773607 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.80.111018106 miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.323312997 miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.8 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miR.518c + 0.790.213697254 miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.376a* + miR.518c + 0.79 0.031045783 miR.660 miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.79 0.258225028 miR.518c +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.362 +miR.376a* + 0.79 0.02212113 miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.376a* + 0.79 0.170310922 miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.26a +miR.376a* + 0.79 0.024719357 miR.518c miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.79 0.204155936 miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.518c + miR.639 +0.79 0.071267072 miR.660 miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.79 0.104625293 miR.639 miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.790.009163906 miR.639 miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.79 0.073238708 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.790.223363007 miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a +miR.26a + miR.376a* + miR.518c + 0.79 0.090110171 miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + 0.790.208790148 miR.660 miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + 0.79 0.309376449 miR.518c + miR.338

TABLE 9 clusters of 9 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + c_taumiR.376a* + Cluster of 9 miRs level miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 NaNmiR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.405184155 miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.246448719 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.196840946miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.329909732 miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.128466451 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.116317947 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 +0.81 0.447554582 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.059893333 miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.463029319 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.039588187miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.012535164 miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.400683559 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.311774714 miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.110070757 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.139809243miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.190392203 miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.081427064 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.048680066 miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.186226373 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.09905613miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 130611427 miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.810.005338207 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.320717135 miR.494 + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.81 0.42529961 miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.334919585miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.067091161 miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.810.014626567 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.495987113 miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.221787351 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.099997395miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.329506061 miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.810.324863522 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.127330549 miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.204887351 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.81 0.427310852miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.232508147 miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.426798872 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.015632232 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.81 0.406477895 miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.107863762miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.378455134 miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.810.354575192 miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.81 0.380394727 miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.399172056 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.81 0.207190665miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.519b + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.296070608 miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.409887674 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.065157593 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + 0.81 0.379025909 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.237552871miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.024425329 miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.810.413149685 miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.481305199 miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + 0.81 0.259947051 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + 0.81 0.460534976miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.29a + 0.81 0.24708209 miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.257662026 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.424422464 miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.479425443 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.81 0.13589269miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + 0.81 0.36967044 miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.089395994 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.298435504 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.376a* + 0.81 0.010543759 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.81 0.480715861miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.081844216 miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.810.342503816 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.098699779 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* +0.81 0.164711094 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.218296942 miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.092864134 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.114699091miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.81 0.303649269 miR.639 + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.297064743 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.81 0.1815712 miR.639 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 +miR.376a* + 0.81 0.21918321 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.81 0.263170677miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + 0.81 0.249212767 miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.488093002 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.130a +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.174142711 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 +0.81 0.425943522 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.81 0.08633331 miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.136399791 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.368636506miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.216977335 miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.35581821 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.81 0.363334394 miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + 0.81 0.264417081 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.29a + 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miR.518cmiR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.8 0.37009407 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.021782704miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.039816049 miR.639 + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.80.011144508 miR.494 + miR.518c miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.44092978 miR.518c + miR.338miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + 0.8 0.137581827 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.009263095miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.29a +miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.010895069 miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.80.017277545 miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.032467834 miR.639 + miR.660miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.392375462 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.8 0.038240115miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + 0.8 0.09606346 miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.80.022539566 miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.399140134 miR.518c + miR.639miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 +miR.376a* + 0.8 0.144676791 miR.518c + miR.639 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.393283621miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.108718229 miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.80.078605663 miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + 0.8 0.20368957 miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.518c +0.8 0.213832161 miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + 0.8 0.244691095 miR.660 +miR.338 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a +miR.369.3p + 0.8 0.360236492 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.376a* + miR.518c + 0.80.142353629 miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.130a +miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.052844987 miR.518c + miR.639miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.130a + miR.29a +miR.376a* + 0.8 0.029623938 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.017294487miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.362 +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.024834852 miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.80.155807164 miR.639 + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.8 0.238139694 miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.8 0.207790313 miR.639 + miR.338 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.116866676miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.140009465 miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.80.133472241 miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.115608628 miR.639 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + 0.8 0.126671162 miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + 0.8 0.057914406miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.132734107 miR.518c + miR.338 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + 0.80.166407828 miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.066227121 miR.518c + miR.639miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.8 0.171844452 miR.639 + miR.660 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.091869834miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.086101572 miR.518c + miR.338 miR.609 +miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.80.349722804 miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.432397172 miR.518c + miR.338miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 +0.8 0.128742377 miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.519b + miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.022446774 miR.639 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + 0.8 0.149018493 miR.639 + miR.338 miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.104536552miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.110908764 miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.80.064289596 miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.04786143 miR.518c + miR.639miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* +miR.494 + 0.8 0.026086832 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.202312429miR.518c + miR.338 miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.369.3p + 0.8 0.432735808 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.80.15793484 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.08087559 miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + 0.8 0.092391206 miR.518c + miR.639 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.479385389miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + 0.8 0.063910988 miR.639 + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.80.03309098 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.082814397 miR.518c + miR.639miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* +miR.494 + 0.8 0.085588816 miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.494 + 0.8 0.018293817miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.042337528 miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + 0.80.058870396 miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.13154698 miR.494 + miR.518cmiR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.430628151 miR.518c + miR.338 miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.049252717miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.130a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.120103833 miR.518c + miR.338 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.80.067806989 miR.639 + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.221127196 miR.518c + miR.660miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* +miR.518c + 0.8 0.302752216 miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.132855449miR.494 + miR.518c miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.450491072 miR.518c + miR.639 + miR.660miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.8 0.084150772 miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.8 0.165261001miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.29a +miR.376a* + miR.518c + 0.8 0.030694635 miR.660 + miR.338

TABLE 10 clusters of 10 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + c_tau miR.369.3p +miR.376a* + Cluster of 10 miRs level miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 NaNmiR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.242090457 miR.376a* + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.305884533 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.496600392 miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.176882281 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.209905826 miR.376a* + miR.518c + miR.639miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.177508558 miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.13465496miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.297307498miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.223947224 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.21718402 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.157448882miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.269392482 miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.382825458 miR.376a* + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.141825603 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.810.070542282 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.292740124 miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.384087979 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.308180061 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.37505175miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.277532588 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.146358228 miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.472431482 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.295395022miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.256455357 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.307836339 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.458941312 miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.08413771 miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.425031749 miR.376a* + miR.494 +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.073664811 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.327162696 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.415701525 miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.351475224 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.072059664 miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.440507773miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.269521529miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + 0.81 0.298687934 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.004441999 miR.376a* + miR.494 + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.141098979 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.063444211miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.054972939miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.064183216 miR.362 + miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.292553142 miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.378239996 miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.037056936 miR.376a* +miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.050284986 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518cmiR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.476759421 miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.017873439miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.23623766 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.29a + 0.81 0.114412749 miR.362 + miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.315070621 miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.228951442miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.426409297 miR.376a* + miR.518c +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.04004517 miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.810.001870538 miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.006986126 miR.376a* +miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.304421744 miR.376a* + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.216822953 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.810.108357368 miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.03215356 miR.376a* +miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.391842764 miR.376a* + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +0.81 0.003073458 miR.362 + miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.487671446miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.005624385 miR.362 + miR.376a* +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.489205609 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.810.032725563 miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.051081681miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.063867955 miR.376a* + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.352231088 miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a +0.81 0.091683373 miR.362 + miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.019374327miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.000472352 miR.494 + miR.518c +miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p +0.81 0.337869581 miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.810.007843322 miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.066267481 miR.376a* +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.333854732 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 +0.81 0.156363682 miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.001727364miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.01944327 miR.376a* + miR.518c +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.013873658 miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.376a* + 0.810.099460898 miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.131557674 miR.376a* +miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.304698544 miR.376a* + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.464408364 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.448232041miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + 0.81 0.230587013 miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.193908206 miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.475902061 miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.008531382miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.276900513 miR.376a* + miR.518c + miR.639 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0.096384101 miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.80.262497855 miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.8 0.010450007miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a +miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.029097308 miR.494 + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + 0.8 0.06745849 miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.369.3p + 0.8 0.283883726miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.017728004 miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + 0.8 0.273769934 miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a +0.8 0.002350801 miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.246318434miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.056916651 miR.494 + miR.518c +miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.376a* +miR.494 + 0.8 0.040606025 miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a* + 0.80.255488044 miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.8 0.233109969 miR.376a* +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.26a +miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.110347189 miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + 0.8 0.027243459 miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.80.241113713 miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.376a* + 0.8 0.014144873 miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.8 0.296740788 miR.376a* + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.80.194761578 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.8 0.01661889miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.519b +miR.29a + miR.369.3p + 0.8 0.30150057 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.29a +miR.362 + 0.8 0.075560534 miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.376a* + 0.80.015720296 miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.8 0.067265192 miR.376a* +miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a +miR.362 + miR.376a* + 0.8 0.262933746 miR.494 + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.8 0.072646365 miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + 0.80.233858196 miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.8 0.351462549 miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.8 0.408604619 miR.376a* + miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.29a +0.8 0.007457304 miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.8 0.176968562miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.8 0.041621787 miR.376a* + miR.518c +miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.376a* + 0.8 0.036583587 miR.494 + miR.518c + miR.639

TABLE 11 clusters of 11 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + c_taumiR.518c + miR.639 + Cluster of 11 miRs level miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 NaN miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.157246016 miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.171856579miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.496362599 miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.146004635 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.091948512 miR.376a* + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.181963139 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +0.81 0.165405632 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.092406785 miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.329353441miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.213883456miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.150894928miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.16646344miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.055438935 miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.067433109 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.208951906 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + 0.81 0.094187974 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a +0.81 0.106889517 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.810.167163633 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.274816579 miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.085174637miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.199200667miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.121073665miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.010508988miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.254433993 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.191974648 miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.059765494 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.411235756 miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +0.81 0.07159897 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + 0.810.098482424 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.810.128718078 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.810.080417628 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.810.05140153 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.810.227723131 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.810.178842795 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.810.13587915 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.810.090644921 miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.066839667miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.105045113 miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.066839667miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.049902204miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.089387076 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.066355389 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.045991693 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.272054339 miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.131669372 miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a +0.81 0.0583122 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.810.18247775 miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.109488784miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.079074586miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.028631288miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.235907465miR.494 + 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+ miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.12240663 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + 0.81 0.190655218 miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.29a +0.81 0.033349431 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.810.01826168 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.146018166miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.035714228 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.29a + miR.376a* + 0.81 0.008513863 miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.03394552 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.130a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.078037577 miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.376a* + 0.81 0.004743588 miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a +0.81 0.059889168 miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338

TABLE 12 clusters of 12 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + c_tau miR.518c + miR.639 + Clusters of 12 miRs levelmiR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 NaN miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.002592812 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.488531084 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.336902282 miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.02007668 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.177098203 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.189132192 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.326944202 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.124009861 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.141408293 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.126183915 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.050609288 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.065026461 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.058482956 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.412377362 miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.107094527 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + 0.81 0.06586111 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.242438064 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.081782138 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.027361624 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.29a + 0.81 0.15418724 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + 0.81 0.083490286 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.06569385 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.201067691 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.078405114 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.061031771 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.215506409 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.130a + miR.29a + 0.81 0.032147086 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.210865186 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.182910244 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.114604304 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.130a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + 0.81 0.146794034 miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.076886713 miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.015969629 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.09854142 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.079364664 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.034275923 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.202746634 miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.155445223 miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.101826296 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.268917868 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + 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miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.024900079 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.012540071 miR.29a + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.014852528 miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.117838095 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.81 0.019448369 miR.29a + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.056690145 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.057877174 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.016410248 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.026981964 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.130a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.099572501 miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.113619614 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.013267938miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.012488873miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.082804278miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.107391331miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.070220752miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.810.112781487 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.285336004 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338

TABLE 13 clusters of 13 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + c_tau miR.518c + miR.639 + miR.60 + Cluster of 13miRs level miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + 0.82 NaN miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.472941439 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.445059025 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.464030389miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.272060897 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 +0.81 0.363975285 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.447323743 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.366518399 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.314675009 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.20443385 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.424259484miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.362 +0.81 0.268558591 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.29a + 0.81 0.193645248 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.408551927 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.164812906 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.28390477 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.287064031miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.810.377718286 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.495493491 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.299726626 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.129683152 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.393237863 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.810.09061259 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 +0.81 0.374257772 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.428506317 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.378482633 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.154696043 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.461459422miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a +0.81 0.131097854 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.120540301 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.23188802 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.338325475 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.115593707 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.357504945miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a +0.81 0.404005572 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.096770394 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.447201342 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.214286829 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.298233807miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.810.180517781 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.280699357 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.182193834 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.137041633 miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.417142274 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.199437025miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + 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miR.519b + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.081031334 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + 0.81 0.037621692 miR.26a + miR.29a + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.055365894 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.113968637 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.810.03505868 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.050652216 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.26a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.315190456 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.114933733 miR.362 + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.099823206 miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.810.115593279 miR.29a + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.29a +0.81 0.054685768 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.14649747 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.042425785 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.023002691 miR.29a + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.391306838 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.043584453miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.810.253779002 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +0.81 0.023286823 miR.362 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.124610367 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.201195729 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.347221247 miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.281132438 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.083637503miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + 0.81 0.291545586 miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.073905315 miR.362 + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.087195074 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.043064954 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.810.478390968 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.061718871 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.81 0.107551914 miR.29a + miR.362 + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.071885439 miR.362 + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.367884507 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.295403231miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.362 + 0.810.129392208 miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.079518032 miR.362 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.328184604 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.048286108 miR.362 + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.047126318 miR.29a +miR.362 + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.197656575miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.203443026 miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + 0.81 0.113225883 miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.115644894 miR.362 + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.092194271 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.810.358832089 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.033923581 miR.29a + miR.362 + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.036992373 miR.362 + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.284745688 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.362 + 0.81 0.124693966 miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.044327285miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.810.109366469 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.096025553 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.039254335 miR.362 + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 0.135571984 miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.054449119 miR.362 +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.10526367miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.110763733 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.81 0.051269285 miR.29a + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.04037021 miR.362 + miR.376a* +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338

TABLE 14 clusters of 14 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + c_tau miR.494 + miR.518c + miR.639 + Cluster of14 miRs level miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.82 NaN miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.82 0.301591691miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.82 0.165411135 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.82 0.025209783 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.82 0.003221038miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.82 0.389830678 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.29a + miR.362 + 0.82 0.496123065 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.444774953miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.104413155 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.435667582 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.48987011miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.265407378 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.207501296 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.418811391miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.073133149 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.128223285 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.495657306miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.429185148 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.304888846 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.426980358miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.29a +miR.362 + 0.81 0.489476287 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.221998549 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.810.398743697 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + 0.81 0.168300629 miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.229918161miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + 0.81 0.199585294 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.11973122 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.3394704miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.071730683 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.29a + 0.81 0.48233317 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.430921212miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.489277602 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.292052047 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.419601156miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.211626212 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.152572763 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.112197842miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.24638012 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.155399238 miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.346202758miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + 0.81 0.413635986 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.310443044 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.277978248miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.26a +miR.29a + 0.81 0.272404322 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.444636774 miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.810.449201083 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + 0.81 0.1163453 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.81 0.130939588 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.29a + 0.810.425067482 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + 0.81 0.322956275 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.81 0.200030524 miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a +0.81 0.119283338 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.81 0.321776587 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.519b + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.81 0.263868072 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.810.240312996 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.81 0.221884353 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.194986273 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a +0.81 0.341674651 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + 0.81 0.237751 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.314605021 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.261981571 miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.179522142 miR.29a + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.234449206miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.181803011 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.237494151 miR.26a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.810.279903675 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.29a + 0.81 0.399037769 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* 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+ miR.660 + miR.338 miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.00955262 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 +0.78 0.011944047 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.78 0.019952903 miR.29a + miR.369.3p + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.78 0.030585667 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.780.02036552 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.78 0.022737674 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.78 0.002284354 miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.780.017434767 miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.78 0.019895237 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.006389498 miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.780.023506388 miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.78 0.012217828 miR.29a + miR.362 + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.004743746 miR.362 +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.780.010958841 miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.78 0.004310703 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.78 0.001676862 miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.770.010269422 miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + miR.362 + 0.77 0.010915222 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.018014321 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.77 0.00816644 miR.26a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.77 0.011387087 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.362 + 0.77 0.011993783miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.77 0.010071406 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.011844227 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.022616737miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.338 miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.77 0.002355668 miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.77 0.002827991 miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.008202613miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 +0.77 0.002968385 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.77 0.014012981 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.014131251 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.77 0.003183899 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.77 0.001665673 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + 0.77 0.018514106miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.77 0.004861981 miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.001455528 miR.362 + miR.369.3p +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.004785135miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + 0.76 0.000466356 miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.519b +miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.76 0.001480874 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.76 0.001666107miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a +0.76 0.002647249 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.29a + 0.76 0.002038337 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.75 0.000724525 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.750.000438559 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.75 0.004191131 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a* + miR.494 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.75 0.001704329 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.750.000807655 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 +miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + 0.75 0.001349938 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.75 0.000296002 miR.29a +miR.362 + miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.750.00077583 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.75 0.000781236 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a* +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.75 0.002537045 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a* + miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.740.00066002 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.639 +miR.660 + miR.338

TABLE 15 clusters of 15 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + c_tau miR.376a* + miR.494 + miR.518c + Cluster of 15 miRslevel miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.82 NaN miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.82 0.417893112 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.82 0.421947834 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.29a + 0.82 0.456723659 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.82 0.436472042 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.519b + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.82 0.266119713 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.82 0.026919383 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.29a + 0.82 0.450229229 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.82 0.450046797 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a +miR.29a + 0.82 0.006693682 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.29a + 0.82 0.009272355 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + 0.82 0.455293954 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.482287213 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.81 0.316214873 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.074783672 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.435288591 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.478845578 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.210546057 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.81 0.468227262 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + 0.81 0.223550252 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.286745317 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.391989353 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.103368158 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.489753522 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.092748321 miR.29a +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.474651411 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.162700387 miR.29a +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.17522995 miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.34357476 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.412954075 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.277631728 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.450828429 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a. + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.81 0.288365965 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.2350529 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.215400116 miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.194690338 miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.309617959 miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.161293467 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.215282667 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.10211321 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.093394764 miR.26a +miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.081563215 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.81 0.093913311 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.107763407 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.327963791 miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.118805836 miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.036016323 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.150167898 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.331081172 miR.29a +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.81 0.413196791 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.81 0.03822282 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 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miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.096797657 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.149699339 miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a + miR.26a +0.81 0.063984212 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.131446617 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.810.010680595 miR.29a + miR.362 + miR.376a. + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.81 0.144240395 miR.362 + miR.369.3p +miR.376a. + 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+ 0.80.075661668 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a. + miR.494 +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.8 0.024467973 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.80.020813306 miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.8 0.01599405 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.26a + 0.80.014343674 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.8 0.003784491 miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.80.004771994 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.79 0.025855658 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.790.003847267 miR.26a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.79 0.006399787 miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.790.052750788 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.79 0.045179266 miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.29a + 0.79 0.02591738 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.79 0.043496008 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.79 0.034857672 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.26a + miR.29a + 0.79 0.040182398 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.79 0.05514381 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.79 0.035721744 miR.29a +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.79 0.037218329 miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.020642923 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.78 0.014050884 miR.29a + miR.362 + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.021301208 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.78 0.005883105 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.78 0.013306274 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.78 0.017843499 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + miR.29a + 0.77 0.010286083 miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.76 0.00164717 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.639 + miR.660 + miR.338

TABLE 16 clusters of 16 miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a* + c_tau miR.494 + miR.518c + miR.639 +Cluster of 16 miRs level miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a + 0.82 NaN miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.519b + miR.130a +miR.26a + 0.82 0.346794554 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.82 0.374050841miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.220a +miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0. 82 0.310289635 miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.26a + 0.82 0.366102054 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.82 0.158144613miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c +miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.82 0.445078393 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c + miR.639 + miR.660 +miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.109507894 miR.26a + miR.29a + miR.369.3p + miR.376a. +miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.200650952miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f +miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.217785753 miR.26a + miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + 0.81 0.066505939 miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.073885357miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b +miR.130a + miR.26a + 0.81 0.303472946 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p +miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.810.185015053 miR.26a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + 0.81 0.216679209 miR.26a +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a +miR.519b + miR.130a + 0.8 0.008870546 miR.26a + miR.29a + miR.362 +miR.369.3p + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a + miR.26a + 0.790.038816435 miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338

TABLE 17 best clusters of miRNAs pv compared to top signature miR.558 +miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + miR.130a +miR.26a + miR.29a + pv miR.362 + miR.369.3p + c_tau compared tomiR.376a. + miR.494 + miR.518c + Comparaison between the top clusters ofmiRs level UICC miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.519b + 0.82 3.89631E−09 NaNmiR.130a + miR.26a + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a.+miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.520f + miR.220a + miR.130a + miR.26a 0.82 5.31322E−090.273786656 + miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.520f + miR.130a + miR.26a + 0.82 1.07178E−09 0.46959299 miR.29a +miR.362 + miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.603 + miR.520f + miR.130a +miR.29a + miR.362 0.82 1.57648E−09 0.496622615 + miR.369.3p +miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 +miR.609 + miR.520f + miR.130a + miR.29a + miR.362 + 0.82 3.57144E−090.358285772 miR.369.3p + miR.376a. + miR.494 + miR.518c + miR.639 +miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f + miR.220a + miR.29a +miR.362 + 0.81 4.82435E−09 0.231087673 miR.369.3p + miR.376a. +miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 + miR.520f +miR.29a + miR.362 + miR.369.3p + 0.81 3.58012E−09 0.455646227miR.376a. + miR.518c + miR.639 + miR.660 + miR.338 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 2.32944E−08 0.062628078miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c + miR.660 miR.558 + miR.609 +miR.603 + miR.220a + miR.26a + miR.29a + 0.81 1.12929E−08 0.021753942miR.369.3p + miR.376a. + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.603 +miR.220a + miR.29a + miR.369.3p + 0.81 1.05401E−08 0.003784432miR.376a. + miR.518c miR.558 + miR.609 + miR.220a + miR.29a +miR.369.3p + miR.376a. + 0.8 1.70664E−07 0.016562471 miR.518c miR.558 +miR.609 + miR.220a + miR.29a + miR.376a. + miR.518c 0.8 2.75189E−070.005183149 miR.558 + miR.609 + miR.29a + miR.376a. + miR.518c 0.798.33665E−07 0.007189529 miR.609 + miR.29a + miR.376a. + miR.518c 0.770.000258704 0.001288932 miR.558 + miR.609 + miR.518c 0.76  3.7808E−058.30546E−05 miR.603 + miR.518c 0.73 1.38325E−05 8.07086E−06 miR.609 0.660.071282935 7.46688E−10 UICC 0.59 NaN 3.89631E−09

REFERENCES

Throughout this application, various references describe the state ofthe art to which this invention pertains. The disclosures of thesereferences are hereby incorporated by reference into the presentdisclosure.

-   Galon J, Costes A, Sanchez-Cabo F, Kirilovsky A, Mlecnik B,    Lagorce-Pagès C, Tosolini M, Camus M, Berger A, Wind P, Zinzindohoué    F, Bruneval P, Cugnenc P H, Trajanoski Z, Fridman W H, Pagès F.    Type, density, and location of immune cells within human colorectal    tumors predict clinical outcome. Science. 2006 Sep. 29;    313(5795):1960-4.-   Harrell F E Jr, Lee K L, Mark D B. Multivariable prognostic models:    issues in developing models, evaluating assumptions and adequacy,    and measuring and reducing errors. Stat Med. 1996 Feb. 28;    15(4):361-87. Review.-   Heagerty P J, Zheng Y. Survival model predictive accuracy and ROC    curves. Biometrics. 2005 March; 61(1):92-105.-   Pencina M J, D'Agostino R B Sr, D'Agostino R B Jr, Vasan R S.    Evaluating the added predictive ability of a new marker: from area    under the ROC curve to reclassification and beyond. Stat Med. 2008    Jan. 30; 27(2):157-72; discussion 207-12.

1. A method for predicting the outcome of a cancer in a patientcomprising the steps of determining the expression level of a miRNAcluster in a sample obtained from said patient by i) extracting miRNAsfrom said sample, ii) contacting extracted miRNAs with detectablereagents which hybridize specifically with miRNAs in said miRNA clusterto form detectable miRNA-reagent complexes, and iii) quantitatingdetectable miRNA-reagent complexes as a measure of said expression levelof said miRNA cluster; and comparing the expression level of said miRNAcluster with a reference expression level of said miRNA cluster, whereina difference between said expression level of said miRNA cluster andsaid reference expression level of said miRNA cluster is indicative ofthe outcome of the cancer in the patient; wherein said miRNA clustercomprises at least one of: miR.609, miR.518c, miR.520f, miR.220a,miR.362, miR.29a, miR.660, miR.603, miR.558, miR519b, miR.494, miR.130aand miR.639.
 2. The method according to claim 1 wherein said miRNAcluster comprises the combination miR.603+miR.518c.
 3. The methodaccording to claim 1 wherein said miRNA cluster comprises thecombination miR.558+miR.609+miR.518c.
 4. The method according to claim 1wherein said miRNA cluster comprises the combinationmiR.609+miR.29a+miR.376a.+miR.518c.
 5. The method according to claim 1wherein said miRNA cluster comprises the combinationmiR.558+miR.609+miR.29a+miR.376a.+miR.518c.
 6. The method according toclaim 1 wherein said miRNA cluster comprises the combinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.376a.+miR.518c.
 7. The methodaccording to claim 1 wherein said miRNA cluster comprises thecombinationmiR.558+miR.609+miR.220a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a.+miR.518c.
 8. Themethod according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprises thecombinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a.+miR.518c.9. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.220a+miR.26a+miR.29a+miR.369.3p+miR.376a.+miR.518c+miR.660.10. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a.+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.11. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.220a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a.+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.12. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a.+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.13. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a.+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.14. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a.+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.15. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a.+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.16. The method according to claim 1 wherein said miRNA cluster comprisesthe combinationmiR.558+miR.609+miR.603+miR.520f+miR.220a+miR.519b+miR.130a+miR.26a+miR.29a+miR.362+miR.369.3p+miR.376a*+miR.494+miR.518c+miR.639+miR.660+miR.338.17. (canceled)
 18. The method according to claim 1, wherein said canceris a colorectal cancer.
 19. The method of claim 1, wherein saiddetectable reagents are hybridizable probes or amplification primers.